Дәстүрлі емес діни ұйымдар Қазақстан Республикасының тәуелсіздігі жылдары кеңінен етек жая бастады. Қазақстан қоғамында дәстүрлі емес діндердің бой көрсетуі және қызметі қауіпті тенденцияны байқатты. Гуманитарлық зерттеу орталығының (ГЗО) мәліметі бойынша Қазақстанда «дәстүрлі емес» діндерді ұстанушылардың саны аз болғанымен, ол ұйымдар басқа діни ұйымдарға қарағанда айтарлықтай белсенділігімен ерекшеленеді. Олардың ішінде соңғы онжылдықтары кең таралғаны - протестанттық (христиан діні) бағыттағы діни ұйымдар. Қазақстан батыстық және шығыстық діни экспансияның орталығы болып отыр. Еліміздегі шетелдік христиандық дәстүрлі емес ағымдар: «Йегово куәгерлері» ұйымы, «Грейс-Благодать» шіркеуі, Саентология шіркеуі, «Жетінші күн адвентистері» т.б..
Шығыстық дәстүрлі емес ағымдар: «Кришна санасы қоғамы» (индуизм негізінде, Үндістанда негізі қаланған), Бахай діни ағымы (ислам сектасы), «Бірігу» (Мун) шіркеуі (кореялық, портестанттық ағым). Исламдық теріс ағымдар: уахаббилер, Ахмадия діни ағымы, құраншылар, сопылық ағым, зікіршілер.