40 жыл бойы американдық Гольштейн малдарын генетикалық өсіру (1964-2004) алынатын сүттің көлемінің іс жүзінде түзу өсуіне және фертильділіктің тікелей төмендеуіне әкелді. Осы кезеңде жылдық сүт 79%-ға өсті 6309 кг-нан 11324 кг-ға дейін, алайда 2004 жылғы Гольштейн сиырлары сәтті ұрықтануға 1964 жылғы сиырларға қарағанда шамамен 30 күн ұзағырақ уақыт алды.
Жасанды сұрыптау кезеңдерін білдіретін голштейн ірі қара малының үш тобы іріктеу белгілеріне талданды.
Топ 1 1950-ші жылғы сиырлар биоматериалы
Топ 2 1975-1985 жж. аралығы сиырлар биоматериалы
Топ 3 Соңғы 40 жыл өсірілген сиырлар биоматериалы
SNP генотиптері Illumina BovineSNP5 BeadChip чипі арқылы алынды. 29 аутосома мен Х хромосомасында барлығы 45 878 SNP (50 K).
Гольштейн сиырлары геномындағы өзгерістер
Сурет 1. Гольштейн сиырларына Multidimensional scaling (MDS) сызбасы Гольштейн геномы 1964 жылдан бастап асыл тұқымды емес малдың гномдарынан қазіргі Гольштейн геномдарына дейінгі ландшафттың өзгеруінің уақытша тенденциясын анық көрсетеді. SNP арасындағы қашықтықты екінші өлшеуге қатысты бірінші өлшемнің көпөлшемді масштабтау (MDS) графигі бойынша бірдей, селекцияланбаған мал үшін сол жақ бұрыштан (I топ) селекцияланған мал үшін жоғарғы оң жақ бұрышқа (II және III топтар) қозғалысты көрсетті.
40 жылдық генетикалық селекция нәтижесінде селекцияланған және селекцияланбаған мал арасындағы аллель жиілігінің геномдық айырмашылықтары (AFD) алынды. Фертильділік пен иммунитетке жауапты деп аталатын бірнеше гендерде 1964 жылғы гольштейндер мен 2006-2015 жылдары туылған 294 079 сиыр арасында үлкен AFD болды.
Кесте 1. 1964 жылдан бастап жеке гендердегі аллель жиілігінің өзгеруі. e – фертильділікке қатысты гендер
f – бұлшықет ауруларымен қатысты гендер
g – иммунитетпен қатысты гендер
