2.
Напишите название архива полнотекстовых биомедицинских публикаций со
свободным доступом, созданный Национальной медицинской библиотекой США.
Правильный ответ
: PubMed
Б1.В.07 Молекулярная биология
Тестовые задания закрытого типа:
1.
Какой тип данных, которые можно анализировать в рамках биоинформатики, не
относят к графам или сетям:
(один ответ)
а) метаболические и сигнальные пути;
б) генные сети;
в) экологические сети и пищевые циклы;
г) текущие потоки веществ или зарядов через поверхность клетки.
Правильный ответ: г
2. Что относят к компонентам структуры современной биоинформатики:
(один ответ)
а) высокопроизводительные вычислительные центры;
б) хранилища данных;
в) цифровые библиотеки;
г) все ответы верны.
Правильный ответ: г
3. Возникновение геномики как научной дисциплины стало возможным после:
а) установления структуры ДНК;
б) дифференциации регуляторных и структурных участков гена;
в) создания концепции гена;
г) полного секвенирования генома у ряда организмов.
Правильный ответ: г
Ситуационные задачи:
Развернутое эссе
1.
Опишите, какую информацию Вы сможете получить при поиске сведений о
конкретном белке в
базах данных. Для решения каких прикладных задач Вы эту
информацию смогли бы применить?
Правильный ответ
: Можно получить информацию о первичной структуре белка,
элементах вторичной структуры, пространственной структуре (в том числе в виде
3D-
моделей). Информация будет выдана с указанием организма, из
которого
белок выделен, исходного источника сведений (названия журнала, названия
статьи, авторов и т.п.). Также можно получить информацию о структуре гена,
кодирующего искомый белок, и транскрипта с него (мРНК). Полученную
информацию можно использовать для
проведения сравнительного анализа
структур белка и ДНК данного организма с молекулами, выделенными из другого
объекта, – сравнительная протеомика и геномика, что особенно важно для
установления родства между организмами и выявления путей происхождения
разных видов микроорганизмов, животных и растений. Можно проанализировать
взаимосвязь между модификацией белка и развитием фенотипических
проявлений, например, клинических симптомов заболевания – это необходимо
для разработки новых
методов диагностики и лечения патологии (в частности, как
поиск мишени в драг-дизайне). 3D-структуры белков можно использовать для
проведения процедуры молекулярного докинга, который позволит очертить круг
химических соединений,
способных выступать в роли лиганда по отношению к
анализируемому белку.