практически весь водород на Земле находится в виде соединений;
в свободном состоянии водород встречается крайне редко, лишь в очень незначительном количестве (в виде простого вещества водород содержится в атмосфере в количестве 5·10-5 % по объёму);
водород выделяется в свободном состоянии при извержении вулканов, находится в газообразных продуктах выделения фумарола, а также присутствует в виде включений в калийных солях, некоторых других минералах, в изверженных горных породах (гранит, гнейсы, базальты);
свободный водород содержится в некоторых природных и попутных газах ряда нефтяных месторождений, однако в результате геологических процессов в атмосферу переходит гораздо меньше водорода, чем от биологических превращений;