Экзаменационный билет №9 1.Дескрипторы. Кодирование молекулярной структуры вещества. Дескриптор как параметр, характеризующий строение органических соединений, некоторые особенности структур
Дескри́птор (от лат. descriptor «описывающий») — лексическая единица (слово, словосочетание) информационно-поискового языка, служащая для описания основного смыслового содержания документа или формулировки запроса при поиске документа (информации) в информационно-поисковой системе. Дескриптор однозначно ставится в соответствие группе ключевых слов естественного языка, отобранных из текста, относящегося к определённой области знаний.
Принципы кодирования молекулярных структур в системе SMILES
Теоретической базой системы SMILES является теория графов. Запись SMILES получается в результате обхода вершин молекулярного графа в глубину.
Органогенные атомы водорода (связи C−H, N−H, O−H, S−H) удаляются и в записи SMILES не обозначаются.
Все циклы разъединяются так, чтобы граф представлял собой так называемое остовное дерево, то есть ациклический связный подграф, сохраняющий все вершины исходного графа. Места разъединения обозначаются числами, показывающими наличие связей в исходной молекуле.
3. Точки ветвления обозначаются круглыми скобками.
4. Элементы, связанные ковалентной связью с углеводородным радикалом, заключаются в квадратные скобки, кроме B, N, P, O, S и галогенов F, Cl, Br, I и т.д.
Дескриптор химической структуры – это число или набор чисел различной природы, которые характеризуют структуру и свойства органического соединения. В настоящее время известно свыше 7000 дескрипторов. Дескрипторы молекулярной структуры представляют собой численные характеристики, отражающие структурные особенности молекулы. В общем случае, все дескрипторы принято условно делить на две группы: индексы электронной структуры и энергетические индексы. Первые позволяют судить о распределении электронной плотности в молекуле, характере - электронного связывания, полярности молекулы, количестве и пространственном расположении электрофильных и нуклеофильных центров, неспаренных электронов в радикалах.