95
нении узлов кластера напрямую кабелем cross-over. При этом (для ядра
2.4) результаты тестов UDP_RR (на пакетах длиной 16 байт) возраста-
ют с 5230 до 4590, но эти результаты уступают типовым при работе с
картами Fast Ethernet (например, 7210 для EtherExpress Pro 100.
Это говорит о том, что применение Gigabit Ethernet более эффек-
тивно при распараллеливании, характеризующемся обменом сообще-
ниями больших размеров. Нагрузка на процессор в netperf-тестах
STREAM в среднем не превышала 30%, т.е. производительность про-
цессора не является лимитирующим фактором. С учетом того, что эти
сетевые платы стоят на порядок дороже, чем Fast Ethernet (не считая
стоимость коммутатора), применение подобных карт в таких ПК-
серверах с 32-разрядной шиной PCI (в частности, для многих задач
вычислительной химии) не является сегодня эффективным по соотно-
шению стоимость/производительность.
Главным направлением, обеспечивающим эффективное распарал-
леливание (в частности, в кластерах) задач квантовой химии в приме-
нении к сверхбольшим молекулярным системам является, с точки зре-
ния авторов, «пофрагментный» подход с использованием локализо-
ванных орбиталей. Так, например, традиционные полуэмпирические
схемы метода ССП распараллеливаются плохо. Однако авторами с
использованием оригинальной методики применения локализованных
орбиталей в полуэмпирических схемах ССП и средств MPI недавно
была распараллелена программа, и предварительные оценки показы-
вают на хорошую эффективность распараллеливания в кластере
FastEthernet.
Достарыңызбен бөлісу: