Действие, которое началось в прошлом, продолжалось в течение некоторого времени и закончилось непосредственно перед определенным моментом в прошлом:
We had been working hard and managed to finish the project in time.
Мы упорно работали и смогли завершить проект вовремя.
Действие, которое началось в прошлом, продолжалось в течение некоторого времени и все еще продолжалось в определенный момент в прошлом:
Her voice started to tremble. I did not realize what a hard time she had been having.
Ее голос задрожал. Я и не представлял, как тяжело ей приходилось.