Қазақстан Республикасының Ғылым және Жоғарғы Білім министрлігі



бет3/3
Дата17.10.2023
өлшемі406,1 Kb.
#117052
түріЛекция
1   2   3
SNPa

frequency of ‘allele 1’ in population

chr

position (bp)

gene

b

II b

III b

Current c

AFD d

X

114,995,979

ADGRG2 e

0.99

0.62

0.45

0.39

0.60

10

28,703,125

AVEN e

0.02

0.30

0.51

0.59

0.56

X

116,153,810

DMD f

0.05

0.46

0.53

0.58

0.53

3

98,450,919

SPATA6 e

0.08

0.53

0.57

0.59

0.51

2

100,376,419

ERBB4 e

0.08

0.29

0.47

0.56

0.48

23

27,215,001

SKIV2L e

0.37

0.58

0.78

0.84

0.47

1

88,050,696

USP13 g

0.22

0.57

0.63

0.64

0.42

11

6,724,678

IL1R2 g

0.68

0.33

0.29

0.26

0.42

13

76,932,968

SULF2 e

0.19

0.38

0.51

0.61

0.41

26

17,465,791

BLNK g

0.41

0.74

0.79

0.83

0.41

19

24,812,617

SPATA22 e

0.80

0.49

0.42

0.39

0.40

23

25,552,635

BOLA-DRB2 g

0.22

0.49

0.60

0.62

0.40

1

65,433,706

GSK3B g

0.54

0.21

0.17

0.16

0.38

12

35,934,370

LATS2 e, g

0.42

0.23

0.14

0.08

0.34


























Сурет 2. Аллель жиілігінің айырмашылығы (AFD) және гаплотиптердің кеңейтілген гомозиготалық қашықтықтары бар гаплотиптер
Майдың оң әсерін сұрыптау жақын маңдағы DGAT1 аймақтарына да қатысты. Көлемі 2,08 Мб және ұзындығы 1,379,063-3,464,083 ж.н. Гольштейн сиырларының үлкен таңдамасында және селекцияланбаған гольштиндерде (I топ) 42 SNP болды. 42 SNP ішінен қазіргі Гольштейн популяциясындағы 294 079 сиырдың 38 SNP жиілігі майдың шығуына оң әсер ететін және сүт пен ақуыздың шығуына теріс әсер ететін аллельдер үшін селекцияланбаған гольштиндерге қарағанда жоғары болды
Сурет 3. DGAT1 және көршілес SNP-тердің 2,08 Mb көлеміндегі және ұзындығы 1379063-3464083 ж.н. май әсері оң селекцияға ұшырады

Қорытынды

Популяциялық генетика әрдайым жануарлардың генетикалық сұрыптау стратегияларын әзірлеудің негізі болды және келешекте де болады. Аддитивті генетикалық вариацияны қолданатын селекция және аддитивті емес генетикалық вариацияны қолдану үшін малды таңдап алу және шағылыстыру жалғасады. Дамып жатқан компьютерлік және биологиялық технологиялар мен әдістер бұл процесті жетілдіруге және оны күрделендіруге мүмкіндік береді.


Селекция әрдайым белгілі бір қасиетті жақсартуға мақсатталады. Бұл мақсатта белгілі бір тұқым дараларын өзара жиі шағылыстыруы мүмкін, тіпті белгілерді бекіту үшін кейде жақын туыс дараларды шағылыстырады. Өсімдіктерді бұл процесс зияндылығы төмен, бірақ жануарларды бұл ауру мен иммунитеті төмен даралардың пайда болуына алып келуі әбден мүмкін. Осыны алдын алу үшін популяциялық генетикаға жүгінеміз. Популяциялық генетика әдістері арқылы популяция денсаулығын, ондағы аллельдер жиілігін және т.б. критерийлерді қарастырып, болашақ селекциялық жұмыстарға бағыт-бағдар ала аламыз.

Әдебиеттер тізімі




  1. Ma L, Sonstegard TS, Cole JB, VanTassell CP, Wiggans GR, Crooker BA, Tan C, Prakapenka D, Liu GE, Da Y. Genome changes due to artificial selection in U.S. Holstein cattle. BMC Genomics. 2019 Feb 11;20(1):128. doi: 10.1186/s12864-019-5459-x. PMID: ./30744549; PMCID: PMC6371544.


Достарыңызбен бөлісу:
1   2   3




©emirsaba.org 2024
әкімшілігінің қараңыз

    Басты бет