Биоинформатика Зертханалық сабақ 1

CLUSTALW сізге филогенетикалық ағашты автоматты түрде салады. Беттің төменгі жағындағы ашылмалы мәзірден «Dendrogram»

жүктеу/скачать 32,88 Kb. бет 4/4 Дата 14.10.2023 өлшемі 32,88 Kb. #113793 түрі Сабақ

CLUSTALW сізге филогенетикалық ағашты автоматты түрде салады. Беттің төменгі жағындағы ашылмалы мәзірден «Dendrogram» немесе «Rooted Dendrogram» түймесін басыңыз. Экранда пайда болған ағашты басып шығарыңыз. Бұл ағаштағы ақпарат α-гемоглобиндер кестесі үшін аминқышқылдарының теңестіруіндегі пайыз сәйкестігі туралы жоғарыдағы талдауыңызбен сәйкес келе ме? Түсіндіріңіз. _______________________________________________________________________ _______________________________________________________________________ _______________________________________________________________________ _______________________________________________________________________ 15. Жарқанаттар, құстар және сүтқоректілер үшін салған филогенетикалық ағаштың дұрыстығын бағалаудың бір жолы - оны басқа белоктардың тізбегінен жасалған ағаштармен салыстыру. Ағашыңызды β-гемоглобин тізбегін іздейтін серіктесіңіз салған ағашпен салыстырыңыз. β-гемоглобин тізбегінен алынған ағашыңыз β-гемоглобин тізбегінен алынған ағашпен сәйкес келе ме? Бұтақтардың салыстырмалы ұзындықтары бірдей ме? _______________________________________________________________________ _______________________________________________________________________ 16. (ҚОСЫМША) Уақыт болса, төмендегілер сияқты басқа түрлермен жасаған салыстыруларды қайталаңыз: а. Киттерді сүтқоректілермен және балықтармен салыстырыңыз. б. Бауырымен жорғалаушыларды құстар мен сүтқоректілермен салыстырыңыз. Бағалау критерийлері: UnitProtKB сайтында жарқанат, құс және сүтқоректілер α –гемоглобин және β -гемоглобин ақуыздарының аминқышқылдық тізбегін жүйелі іздейді 2 CLUSTALW сайтын түрлі ағзалардың гемоглобин ақуызы амин қышқылдық тізбегі арасындағы реттілік ұқсастықтарын іздеу және туралау аймақтарын көрсету үшін пайдаланады 2 SWISSPROT дерекқорынан алынған тірі ағзалардың гемоглобин ақуызына арналған аминқышқылдарының реттілігі бағалайды 2 α-гемоглобин және β -гемоглобин үшін аминқышқылдарының туралануының пайыздық сәйкестігін анықтайды; 2 CLUSTALW сайтында филогенетикалық ағашты талдайды және бағалайды. 2 Жалпы 10 жүктеу/скачать 32,88 Kb. Достарыңызбен бөлісу: