"фараби əлемі" атты халықаралық ғылыми конференция материалдары
СТРЕССОУСТОЙЧИВЫЕ ГЕНЫ АРАХИСА
жүктеу/скачать 2,79 Mb. Pdf көрінісі
|
| СТРЕССОУСТОЙЧИВЫЕ ГЕНЫ АРАХИСА
Тауасарова М.К. Казахский Национальный Университет им.аль-Фараби Makpal.Tauasarova@kaznu.kz Арахис (Arachis hypogaea L.) является всемирно важным урожаем для потребления человеком в качестве хорошего источника белка и растительного масла. Арахис широко культивируется по всему миру в тропическом, субтропическом и теплом умеренном климате. Из-за огромного размера генома (2,8 ГБ) и незрелого генома исследования по геномике и генетической модификации арахиса по сравнению с другими образцовыми культурами меньше. Поскольку арахис можно культивировать в засушливых и полузасушливых районах, а его рост сильно зависит от различных стрессов, которые уменьшают выход. Поэтому изучение генов, чувствительных к стрессу, и его регуляция очень важны. Сообщаем об идентификации и аннотации некоторых генов-кандидатов арахиса, чувствительных к стрессу Expressed Sequences Tags (ESTs). Выбор генов был основан на общедоступных данных 135 экспрессии. Благодаря хорошей базы данных экспрессии и отсутствия доступной литературы по арахису, были исследованы некоторые гены, которые чувствительных к стрессу. Индивидуальный EST указанной группы подвергали дополнительному поиску в EST арахиса (1, 78, 490 целых последовательностей EST) с использованием вычислительного подхода. Различные инструменты, такие как EST Trimmer, Vec-Screen, Repeatmasker, DNA Baser использовались для идентификации и аннотации стрессоустойчивых генов. Исследовательский прогресс, достигнутый в отношении сборки контигов, определения биологической функции генов и прогнозирования домена, а также трехмерной структуры для связанного белка. жүктеу/скачать 2,79 Mb. Достарыңызбен бөлісу:
|