Адамның көзі 250 мм-ге жуық ыңғайлы оптикалық қашықтықта жұмыс істегенде 150 микроннан аспайтын құрылымдарды ажырата алмайды. Әр түрлі типтегі микроскоптар 150 микроннан аспайтын құрылымдарды диагностикалау үшін қолданылады, атап айтқанда микроорганизмдер, өсімдіктер мен жануарлар жасушалары, кристалдар, металдар мен қорытпалардың микроқұрылымдарының бөлшектері. Стереомикроскопты қолдану арқылы микро нысандардың пішінін, өлшемін, құрылымын және басқа да көптеген сипаттамаларын дәлірек анықтауға болады.
Ғылыми зерттеулерден басқа стереомикроскоптар техникада қолданылады, мысалы, баспа платаларының сапасын бақылау үшін