В данном обзоре рассмотрены основные методы создания гетерологических биохимических путей в различных организмах, основные проблемы, воз- никающие при этом, и основные подходы к их ре- шению


Partow S. // Biotechnol. Lett. 2016. V. 38. № 3. P. 503–508



Pdf көрінісі
бет14/15
Дата17.01.2023
өлшемі0,69 Mb.
#61672
1   ...   7   8   9   10   11   12   13   14   15
Байланысты:
Лекция №6.1


Partow S. // Biotechnol. Lett. 2016. V. 38. № 3. P. 503–508.
60. Ryan K.L., Moore C.T., Panaccione D.G. // Toxins (Basel). 


ОБЗОРЫ
ТОМ 12 № 2 (45) 2020 | 
ACTA NATURAE
39
2013. V. 5. № 2. P. 445–455.
61. Montiel D., Kang H.S., Chang F.Y., Charlop-Powers Z., 
Brady S.F. // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2015. V. 112. № 29. 
P. 8953–8958.
62. Chiang Y.M., Oakley C.E., Ahuja M., Entwistle R., Schultz 
A., Chang S.L., Sung C.T., Wang C.C.C., Oakley B.R. // J. Am. 
Chem. Soc. 2013. V. 135. № 20. P. 7720–7731.
63. Kim J.H., Lee S.R., Li L.H., Park H.J., Park J.H., Lee K.Y., 
Kim M.K., Shin B.A., Choi S.Y. // PLoS One. 2011. V. 6. № 4. P. 
e18556.
64. Fran
çois I.E.J.A., De Bolle M.F.C., Dwyer G., Goderis 
I.J.W.M., Woutors P.F.J., Verhaert P.D., Proost P., Schaaper 
W.M.M., Cammue B.P.A., Broekaert W.F. // Plant Physiol. 2002. 
V. 128. № 4. P. 1346–1358.
65. Zhang B., Rapolu M., Liang Z., Han Z., Williams P.G., Su W.W. 
// Sci. Rep. 2015. V. 5. P. 8541.
66. Kapust R.B., Waugh D.S. // Protein Expr. Purif. 2000. V. 19. 
№ 2. P. 312–318.
67. Geib E., Brock M. // Fungal Biol. Biotechnol. 2017. V. 4. № 1. 
P. 13–24.
68. Hawkins K.M., Smolke C.D. // Nat. Chem. Biol. 2008. V. 4. 
№ 9. P. 564–573.
69. Du J., Yuan Y., Si T., Lian J., Zhao H. // Nucl. Acids Res. 2012. 
V. 40. № 18. P. e142.
70. Yuan Y., Du J., Zhao H. // Methods Mol. Biol. 2013. V. 985. 
P. 177–209.
71. Gibson D.G., Young L., Chuang R.Y., Venter J.C., Hutchison 
C.A., Smith H.O. // Nat. Methods. 2009. V. 6. № 5. P. 343–345.
72. Iverson S.V., Haddock T.L., Beal J., Densmore D.M. // ACS 
Synth. Biol. 2016. V. 5. № 1. P. 99–103.
73. Weber E., Engler C., Gruetzner R., Werner S., Marillonnet S. 
// PLoS One. 2011. V. 6. № 2. P. e16765.
74. Engler C., Youles M., Gruetzner R., Ehnert T.M., Werner S., 
Jones J.D.G., Patron N.J., Marillonnet S. // ACS Synth. Biol. 
2014. V. 3. № 11. P. 839–843.
75. https://eu.idtdna.com/pages/products/custom-dna-rna/
large-scale-synthesis
76. https://www.twistbioscience.com/
77. Lussier F.X., Colatriano D., Wiltshire Z., Page J.E., Mar-
tin V.J.J. // Comput. Struct. Biotechnol. J. 2012. V. 3. № 4. P. 
e201210020.
78. Plotkin J.B., Kudla G. // Nat. Rev. Genet. 2011. V. 12. P. 32–42.
79. Kwon K.C., Chan H.T., Le
ón I.R., Williams-Carrier R., Bar-
kan A., Daniell H. // Plant Physiol. 2016. V. 172. P. 62–77.
80. Athey J., Alexaki A., Osipova E., Rostovtsev A., Santana-
Quintero L.V., Katneni U., Simonyan V., Kimchi-Sarfaty C. // 
BMC Bioinformatics. 2017. V. 18. № 1. P. 391–400.
81. https://www.benchling.com/
82. Otto M., Teixeira P.G., Vizcaino M.I., David F., Siewers V. // 
Microb. Cell Fact. 2019. V. 18. № 1. P. 205–221.
83. Gao S., Tong Y., Zhu L., Ge M., Zhang Y., Chen D., Jiang Y., 
Yang S. // Metab. Eng. 2017. V. 41. P. 192–201.
84. Carlsen S., Ajikumar P.K., Formenti L.R., Zhou K., Phon 
T.H., Nielsen M.L., Lantz A.E., Kielland-Brandt M.C., Stepha-
nopoulos G. // Appl. Microbiol. Biotechnol. 2013. V. 97. № 13. 
P. 5753–5769.
85. Rugbjerg P., Naesby M., Mortensen U.H., Frandsen R.J.N. // 
Microb. Cell Fact. 2013. V. 12. № 1. P. 31–39.
86. Avalos J.L., Fink G.R., Stephanopoulos G. // Nat. Biotechnol. 
2013. V. 31. № 4. P. 335–341.
87. Sha C., Yu X.W., Zhang M., Xu Y. // J. Ind. Microbiol. Bio-
technol. 2013. V. 40. № 11. P. 1241–1249.
88. Naqvi S., Zhu C., Farre G., Sandmann G., Capell T., Christou 
P. // Plant Biotechnol. J. 2011. V. 9. № 3. P. 384–393.
89. Chen Y., Daviet L., Schalk M., Siewers V., Nielsen J. // Metab. 
Eng. 2013. V. 15. № 1. P. 48–54.
90. Lian J., Si T., Nair N.U., Zhao H. Food, Pharmaceutical and 
Bioengineering Division 2014 – Core Programming Area 
at the 2014 AIChE Annual Meeting. Atlanta, AIChE, 2014. 
Р. 750–760.
91. Marsafari M., Xu P. // Metab. Eng. Commun. 2020. V. 10. № 1. 
P. e00121.
92. Lv Y., Marsafari M., Koffas M., Zhou J., Xu P. // ACS Synth. 
Biol. 2019. V. 8. № 11. P. 2514–2523.
93. de Jong B.W., Shi S., Siewers V., Nielsen J. // Microb. Cell 
Fact. 2014. V. 13. P. 39–48.
94. Weber H.E., Gottardi M., Br
ückner C., Oreb M., Boles E., 
Tripp J. // Appl. Environ. Microbiol. 2017. V. 83. № 10. P. 
e03472-16.
95. Brown S., Clastre M., Courdavault V., O’Connor S.E. // Proc. 
Natl. Acad. Sci. USA. 2015. V. 112. № 11. P. 3205–3210.
96. Ghosh A., Zhao H., Price N.D. // PLoS One. 2011. V. 6. № 11. 
P. e27316.
97. Si T., Luo Y., Bao Z., Zhao H. // ACS Synth. Biol. 2015. V. 4. 
№ 3. P. 283–291.
98. Miller J.C., Holmes M.C., Wang J., Guschin D.Y., Lee Y.L., 
Rupniewski I., Beausejour C.M., Waite A.J., Wang N.S., Kim 
K.A., et al. // Nat. Biotechnol. 2007. V. 25. № 7. P. 778–785.
99. Barbieri E.M., Muir P., Akhuetie-Oni B.O., Yellman C.M., 
Isaacs F.J. // Cell. 2017. V. 171. № 6. P. 1453–1467.
100. Gassler T., Heistinger L., Mattanovich D., Gasser B., 
Prielhofer R. // Methods in Molecular Biology. 2019. V. 1923. 
P. 211–225.
101. Leynaud-Kieffer L.M.C., Curran S.C., Kim I., Magnuson 
J.K., Gladden J.M., Baker S.E., Simmons B.A. // PLoS One. 
2019. V. 14. № 1. P. e0210243.
102. Tyo K.E.J., Ajikumar P.K., Stephanopoulos G. // Nat. 
Biotechnol. 2009. V. 27. № 8. P. 760–765.
103. Dymond J.S., Richardson S.M., Coombes C.E., Babatz 
T., Muller H., Annaluru N., Blake W.J., Schwerzmann J.W., 
Dai J., Lindstrom D.L., et al. // Nature. 2011. V. 477. № 7365. 
P. 471–476.
104. Wang Y., Shen Y., Gu Y., Zhu S., Yin Y. // Genomics, 
Proteomics Bioinforma. 2018. V. 16. P. 10–16.
105. Looser V., Bruhlmann B., Bumbak F., Stenger C., Costa M., 
Camattari A., Fotiadis D., Kovar K. // Biotechnol. Adv. 2014. 
V. 33. № 6. P. 1177–1193.
106. Yang Z., Zhang Z. // Biotechnol. Biofuels. 2018. V. 11. № 1. 
P. 35–50.
107. Gassler T., Sauer M., Gasser B., Egermeier M., Troyer 
C., Causon T., Hann S., Mattanovich D., Steiger M.G. // Nat. 
Biotechnol. 2020. V. 38. № 2. P. 210–216.



Достарыңызбен бөлісу:
1   ...   7   8   9   10   11   12   13   14   15




©emirsaba.org 2024
әкімшілігінің қараңыз

    Басты бет