11-Билет Биологиялық қосымшаларға барынша сәйкес келетін «ақпарат» ұғымының анықтамасын тұжырымдаңыз
Ақпаратты индекстеу принциптері. Метадеректер
жүктеу/скачать 44,94 Kb.
|
11 20биоинформатика
- Бұл бет үшін навигация:
- 16-Билет 1.Биоинформатика мен ақпараттық биотехнологияның пайда болуы мен дамуына ықпал еткен тарихи мәліметтерге токтал 2.Гендер экспрессиясын талдау
- 3.Секвенирлеу нәтижелерін пайдалану 1.Биоинформатика мен ақпараттық биотехнологияның пайда болуы мен дамуына ықпал еткен тарихи мәліметтерге токтал
| 2.Ақпаратты индекстеу принциптері. Метадеректер
3.Ген экспрессиясын талдау Геннің экспрессиясын талдау оның қызметін зерттеу үшін жүзеге асырылады. Сау және ауру тіндерде қандай гендер көрсетілетіні туралы ақпарат қалыпты функцияға тән ақуыздар жиынтығын да, ауруларға сәйкес келетін ақуыздар құрамының ауытқуларын да анықтауға мүмкіндік береді. Содан кейін бұл мәліметтер әртүрлі аурулардың жаңа диагностикалық сынақтарын, сондай-ақ зардап шеккен гендердің немесе ақуыздардың белсенділігіне әсер ететін жаңа препараттарды жасауда қолданылады. Бұрын гендердің экспрессиясы РНҚ немесе ақуыз деңгейінде, ген-ген принципі бойынша, Нозерн - және Вестерн-блот талдау әдістерін қолдана отырып зерттелген. Қазір барлық гендерді бір уақытта зерттейтін жалпы өрнекті талдау әдістері белгілі. РНҚ деңгейіндегі қарапайым, бірақ салыстырмалы түрде қымбат талдау әдісі-РНҚ жиынтықтарынан немесе кDNA кітапханаларынан немесе тіпті тізбекті мәліметтер базасынан тікелей іріктеу. SAGE (Serial Analysis of Gene Expression – ген экспрессиясының сериялық талдауы, САЭГ) деп аталатын неғұрлым жетілдірілген Әдістемеде әрбір кднқ-дан өте қысқа тізбекті белгілер (әдетте 8-15 нуклеотидтер) синтезделеді, содан кейін олар бірнеше жүзге біріктіріліп, секвенирлеу басталғанға дейін ілініседі. Бір секвенирлеу реакциясында жүздеген түрлі мРНҚ-ның салыстырмалы мазмұны туралы ақпарат алуға болады. Әрбір SAGE тіркесімі әр генді ерекше көрсетеді және сілтемелер санын санау арқылы әр геннің салыстырмалы экспрессия деңгейлерін анықтауға болады. 16-Билет 1.Биоинформатика мен ақпараттық биотехнологияның пайда болуы мен дамуына ықпал еткен тарихи мәліметтерге токтал 2.Гендер экспрессиясын талдау 3.Секвенирлеу нәтижелерін пайдалану 1.Биоинформатика мен ақпараттық биотехнологияның пайда болуы мен дамуына ықпал еткен тарихи мәліметтерге токтал 1866 - Грегор Мендель бұршақ өсімдіктерінде тұқым қуалайтын «факторлардың» таралуы жөніндегі тәжірибелерінің нәтижелерін жариялады. 1917 - Карл Эреки «биотехнология» терминін енгізді. 1928 - Эрвин Шредингер Мендельдің тұқым қуалайтын факторы шамамен 1000 ангстрем деп болжады. 1928 - Александр Флеминг кейбір формалар бактериялардың көбеюін тоқтата алатындығын анықтады алғашқы антибиотик - пенициллиннің ашылуына әкелді. 1933 - Арне Тиселий ерітіндідегі ақуыздар қоспасын электрофоретикалық бөлу әдісін ұсынды. 1943 - Пенициллиннің өнеркәсіптік өндірісі. 1944 - Освальд Эвери, Колин Маклеод және Маклин Маккарти (Освальд) Эвери, Колин Маклеод, Маклин Маккарти) генетикалық материал ДНҚ екенін көрсетті. 1951 . - Линус Карл Полинг пен Роберт Брейнард Кори ақуыздың полипептидтік тізбегімен құрылған құрылымдардың модельдерін ұсынды: α-спираль және β-парақ. 1952 - Розалинд Франклин мен Морис Уилкинс рентген-дифракциялық анализдің көмегімен ДНҚ-ның тұрақты құрылымын ашты. 1953 - Джеймс Дьюи Уотсон мен Фрэнсис Крик ДНҚ-ның қос бұрандалы моделін ұсынды. 1954 - Макс Фердинанд Перуц және ол бастаған ғалымдар тобы ауыр атомдармен изоморфты алмастыру әдістерін жасады, бұл ақуыздың кристаллографиясындағы фазалар мәселесін шешуге мүмкіндік берді. 1955 - Фредерик Сангер сиыр инсулинінің реттілігін ашты. 1957 - Артур Корнберг алғашқы синтетикалық ДНҚ молекуласын жасады. 1961 - «Биотехнология және биоинженерия» журналы құрылды. 1965 ж. - Маргарет Дейхоф бірінші рет Ұлттық биомедициналық зерттеу қорымен (NBRF), ақуыздар тізбегінің дерекқорын құрды. 1966 - Генетикалық код шифрланған. 1968 - Вернер Арбер, Гамильтон Смит және Даниэль Нат рестрикменттік ферменттердің принципін сипаттады. 1969 - Стэнфорд университеті мен Калифорния университетінің компьютерлерін біріктіру, Лос-Анджелес ARPAnet-ке әкеледі. 1970 - Needleman Wunsch тізбегін салыстыру алгоритмінің толық сипаттамасын жариялады. - А.Ж. Гиббс және Г.А. МакИнтайр нүктелік матрица көмегімен екі реттілікті (амин қышқылдары немесе нуклеотидтер) салыстырудың жаңа әдісін сипаттады. 1972 - Пол Берг, лигазды қолданып, алғашқы жасанды рекомбинантты ДНҚ молекуласын жасады. - Стэнли Коэн, Энни Чан және Герберт Бойер рекомбинантты ДНҚ-мен алғашқы ағзаны шығарды. 1973 - Джозеф Сэмбрук және оның жұмыс тобы агарозды гель қолдану арқылы ДНҚ электрофорез әдісін жетілдірді. - Герберт Бойер мен Стэнли Коэн адамның генін ішек таяқшалы плазмидаға ауыстыру арқылы рекомбинантты ДНҚ технологиясын жасады. - «Brookhaven Protein Databank» құрылды. - Роберт Меткалф кандидаттық диссертациясында Ethernet-ті сипаттады. 1974 - Винт Карфф пен Роберт Кан компьютерлік желілерді ғаламдық Интернетке қосу тұжырымдамасын жасап, Трансмиссияны басқару протоколын (TCP) жасады. 1975 - P.X.О'Фаррелл натрий додецил сульфатын қосып, полиакриламидті гельдегі екі өлшемді электрофорез әдісін ойлап тапты. - Эдвард Саут өзінің аналитикалық Оңтүстік блоттау техникасының сипаттамасын жариялады. - Георг Кёлер мен Сезар Милштейн моноклоналды антиденелерді шығару әдісін жасады. - Билл Гейтс пен Пол Аллен Microsoft корпорациясын құрды 1976 - рекомбинантты ДНҚ-мен жұмыс істеудің алғашқы нұсқаулары жарық көрді. 1977 ж. - Фредерик Сангер және Аллен Максам мен Вальтер Гилберт ДНҚ-ның секвенирлеу әдістерін дамытады 1978 - Genentech ішек таяқшасынан адам инсулинін шығарды. 1979 -Лос-Аламос ұлттық зертханасында (LANL), Нью-Мексико, Вальтер Годе және серіктестер алдымен GenBank прототипінің мәліметтер базасына ДНҚ тізбегінің дерекқорларын біріктірді. 1980 - Марк Скольник, Рэй Уайт, Дэвид Ботштейн және Рональд Дэвис RFLP адам геномының маркерін жасады. - Алғаш рет организмнің гендерінің толық тізбегі - бактериофаг «ФХ-174» декодталды. - Вутрич және басқалар ақуыздың құрылымын анықтау үшін көпмөлшерлі NMR әдісін қолдану туралы егжей-тегжейлі мақала жариялады. жүктеу/скачать 44,94 Kb. Достарыңызбен бөлісу:
|