Биоинформатика Зертханалық сабақ 1

CLUSTALW сізге филогенетикалық ағашты автоматты түрде салады. Беттің төменгі жағындағы ашылмалы мәзірден «Dendrogram»

жүктеу/скачать 32,88 Kb.

бет	4/4
Дата	14.10.2023
өлшемі	32,88 Kb.
	#113793
түрі	Сабақ

1 2 3 4

Байланысты:
Биоинформ. Lab-1

CLUSTALW сізге филогенетикалық ағашты автоматты түрде салады. Беттің төменгі жағындағы ашылмалы мәзірден «Dendrogram» немесе «Rooted Dendrogram» түймесін басыңыз. Экранда пайда болған ағашты басып шығарыңыз. Бұл ағаштағы ақпарат α-гемоглобиндер кестесі үшін аминқышқылдарының теңестіруіндегі пайыз сәйкестігі туралы жоғарыдағы талдауыңызбен сәйкес келе ме? Түсіндіріңіз.
_______________________________________________________________________
_______________________________________________________________________
_______________________________________________________________________
_______________________________________________________________________
15. Жарқанаттар, құстар және сүтқоректілер үшін салған филогенетикалық ағаштың дұрыстығын бағалаудың бір жолы - оны басқа белоктардың тізбегінен жасалған ағаштармен салыстыру. Ағашыңызды β-гемоглобин тізбегін іздейтін серіктесіңіз салған ағашпен салыстырыңыз. β-гемоглобин тізбегінен алынған ағашыңыз β-гемоглобин тізбегінен алынған ағашпен сәйкес келе ме? Бұтақтардың салыстырмалы ұзындықтары бірдей ме?
_______________________________________________________________________
_______________________________________________________________________

16. (ҚОСЫМША) Уақыт болса, төмендегілер сияқты басқа түрлермен жасаған салыстыруларды қайталаңыз:

а. Киттерді сүтқоректілермен және балықтармен салыстырыңыз.
б. Бауырымен жорғалаушыларды құстар мен сүтқоректілермен салыстырыңыз.

Бағалау критерийлері:

UnitProtKB сайтында жарқанат, құс және сүтқоректілер α –гемоглобин және β -гемоглобин ақуыздарының аминқышқылдық тізбегін жүйелі іздейді	2
CLUSTALW сайтын түрлі ағзалардың гемоглобин ақуызы амин қышқылдық тізбегі арасындағы реттілік ұқсастықтарын іздеу және туралау аймақтарын көрсету үшін пайдаланады	2
SWISSPROT дерекқорынан алынған тірі ағзалардың гемоглобин ақуызына арналған аминқышқылдарының реттілігі бағалайды	2
α-гемоглобин және β -гемоглобин үшін аминқышқылдарының туралануының пайыздық сәйкестігін анықтайды;	2
CLUSTALW сайтында филогенетикалық ағашты талдайды және бағалайды.	2
Жалпы	10

жүктеу/скачать 32,88 Kb.

Достарыңызбен бөлісу:

1 2 3 4