Генетическая рекомбинация



Дата03.12.2023
өлшемі3,27 Mb.
#133168

Транскрипция у эукариот


Выполнила:Найманшалова Ардак 
Группа: 120А ОМ
Проверила: Ермекова С.А

Транскрипция в митохондриях


РНК полимераза митохондрий человека — одна субъединица с молекулярной массой 134 КДа
Транскрипция в митохондриях
РНК-полимераза митохондрий похожа
на РНК-полимеразу бактериофага Т7

РНК полимеразы эукариот

  • RNA Pol I
    • синтезирует рРНК (28S, 18S, 5.8S)
  • RNA Pol II
    • синтезирует мРНК, мяРНК (малые ядерные)
  • RNA Pol III
    • синтезирует тРНК, 5S рРНК

Кор-фермент каждой RP состоит из более 10 субъединиц
Субъединичный состав РНК полимераз эукариот

Транскрипция происходит в ядре


эухроматин
эухроматин
ЦИТОПЛАЗМА
ЯДРО
Ядрышко
гетерохроматин
гетерохроматин

Гетерохроматин

  • наиболее плотная упаковка ДНК
  • транскрипционно не активен
  • отличается от клетки к клетке

Хроматин


ДНК
1
Нуклеосома состоит из 4 гистонов [(H2A H2B H3 H4)2]
2 витка ДНК (160 п.н.)
Промежутки – гистон Н1
Нуклеосомы
уплотнение в
6-7 раз
Соленоид (30 nm)
40 раз
Петли (300 nm)
680
Хромосома
10000

Хроматин

Промотор RPII


Дополнительные регуляторные
элементы
ТАТА-бокс
Консенсус TATAa/tAa/t
Пиримидин-богатый участок
в точке начала синтеза
PyPyNt/aPyPy
базальный элемент промотора

Основные (базовые) факторы транскрипции

  • для инициации транскрипции на базальном промоторе достаточно кор-фермента и шести основных факторов транскрипции
  • TFIID – основной фактор транскрипции D для РНК полимеразы II

Инициация


-50
-30
-10
+10
+30
TATAAA
D
A
TATAAA
D
B
A
TATAAA
D
Pol II
F
A
B
TATAAA
Pol II
D
F
A
B
E
TATAAA
Pol II
D
F
H
Локальное плавление ДНК
Инициация

Инициация


A
TATAAA
D
Pol II
РНК
Инициация
Фосфорилирование С-концевого домена RPII
A
B
E
TATAAA
Pol II
D
F
H
C-концевой домен обычно состоит из порядка 52 повторений последовательности Tyr-Ser-Pro-Thr-Ser-Pro-Ser
TFIIH гиперфосфорилирует C-концевой домен РНК-полимеразы

TFIIB изгибает ДНК

Основные факторы транскрипции RPII человека


TFIID

TBP

1

38

Связывание с ТАТА

TAF

12

15-250

Узнавание промотора (не ТАТА элементов)

TFIIA

3

12,19, 35

Помощь TFIID

TFIIB

1

35

Связывание и позиционирование RPII

TFIIF

2

30, 74

Привлечение RPII на промотор

RPII

12

10-220

Синтез РНК

TFIIE

2

34, 57

Стимуляция и модуляция TFIIH

TFIIH

9

35-89

Хеликаза и протеинкиназа

Основные факторы транскрипции RPII

Промотор RPII


Дополнительные регуляторные
элементы
базальный элемент промотора

Дополнительные регуляторные элементы


Проксимальные элементы располагаются в пределах 50-200 пар оснований от участка старта транскрипции
Дистальные элементы (энхансеры) могут располагаться на произвольном расстоянии в любой ориентации по отношению к участку старта транскрипции
Места связывания белков-регуляторов. Белок-регулятор может усиливать или ослаблять транскрипцию

Энхансер


может быть удален на расстояние несколько тысяч п.о.
RPII + основные
транскрипционные факторы

Энхансер может быть расположен в - области + области развернут

Медиатор


Уровень транскрипции определяется суммой воздействия всех белков-регуляторов

Способы активации регуляторов транскрипции


активный
не активный регулятор

Инсулятор


Инсулятор (insulator) — фрагмент ДНК, способный блокировать взаимодействие
между энхансером и промотором, если находится между ними

Инсулятор

Где расположен промотор?

Gel-shift анализ

Gel-shift анализ

Gel-shift анализ

Футпринтинг, ДНКаза I

Футпринтинг

Футпринтинг

DMS Footprinting



Достарыңызбен бөлісу:




©emirsaba.org 2024
әкімшілігінің қараңыз

    Басты бет