9.5.2.4 Еріткіштердің улылығы
Тұздану кезеңі уақытында класторидий жасушалық метоболизм, еріткіш концентрациясы 20 г/л
шамасына жеткенге дейін, әдетте, жалғасып жатады, осы деңгейден кейін жасушалар метаболизмі
тоқтатылады. Барлық өндірілетін еріткіштердің ішіндегі, ферменттеу кезінде барлық жасушалар үшін
улы болатын, липофильді еріткіш бутанол ең улы және жалғыз ғана еріткіш болып табылады.
Ферментті сорпаға 7-ден 13 г/л-ге дейін қосылған бутанолдың өсуді 50%- ға баяулатуға әкелетіндігі
көретілді [18]. Бутанол сұйықтың фосфолипидті компоненттерін бұзады [54]. Мембрананың
аққыштығын көбейту мембрананың тұрақтылығының бұзылуына және, глюкоза алу, тасымалдау
процесі мен мембранамен байланысты АТФаза белсенділігі сияқты, мембранамен байланысты
172
функциялардың бұзылуына әкеліп соғады. Бутанолдың улылығы, еріткіш көлемін шектейтін, ацетон-
бутанол-спиртті ашыту кезінде алынатын, негізгі факторлардың бірі болып саналады. Бутанолға
деген жасушалардың төзімділігін арттыру, еріткіштің улылығы мәселесін жоюға көмектесе алады
деген ұсыныс білдірілді. Бутанол-төзімді штаммалардағы маңызды мәселелердің бірі, C.beijerinckii
NCIMB 8052 кездейсоқ мутагенез жолымен алынған [55], штамм C.beijerinckii BA101 болып
саналады. Сол сияқты, глицерин дегидрогеназын кодтайтын [56], бутанол-төзімді мутантты штамм
C.beijerinckii NCIMB 8052 өндіру үшін, gld A геніне мақсатты түрде РНК қарсы мағыналық
технология қолданылды. Температураның жоғарылауымен мембрандық сұйықтықтың көбеюін
қадағалау, еріткіш өндіру кезеңіндегі температураның төмендеуі, бутанолға төзімділіктің өсу
мүмкіндігін болжауға мүмкіндік береді. Осылайша, температураны қышқылдану кезеңі кезінде 30 °C-
тан тұздану кезеңі кезінде 24 °C-қа дейін төмендету арқылы бутанол өндірісін үлкейтуге болады.
Еріткіштің улылығы жөніндегі мәселені жеңудің басқа тәсілі, ферментация кезінде еріткішпен in situ
алу процесін біріктіру болып саналады. Сонымен қатар, метаболиттік және жасушалық инженерия
жүйенің биологиялық тәсілін қолдану, еріткіштеріге төзімдірек клостридий штаммдарын өндіруге
көмектеседі [57].
9.5.2.5 Метаболиттік инженерия
Метаболитті инженерия аясында бутанол-өндіруші клостридий негізгі мақсаты, бутанол өндірісін
соңғы концентрация мен нәтижелілік, бутанолға төзімділікті үлкейту (еріткішке), субстратты
пайдалану диапазонын кеңейту, қоршаған ортаны жобалау мен аралас қышқыл/еріткіштер өндірісінің
орнына селективті бутанол өндірісі үшін метаболиттік желіні өзгерту тұрғысынан қарағанда кеңейту
болып табылады. Бұл мақсаттарды гендік инженерияның, түрлендіру әдістері, шаттл-векторлар және
гендік нокаут жүйелері сияқты, әртүрлі құралдарының көмегімен қол жеткізуге болады.
C. acetobutylicum ATCC 824 күшті шектеу жүйесі бар, код Cac824I (эндонуклейтті шектеу), 5'-
GCNGC-3' мойындайды. Бұл шектеу жүйесі, E.coli алынған, рекомбинатты плазмидті тиімді
трансформациялауды болдырмайды. Сонымен, Мермелштейн және бірлескен автор (1992),
трансформацияның тиімділігін арттыруға мүмкіндік беретін, шаттл-вектор pFNK1 B. subtilis - C.
Acetobutylicum зерттеді [58]. Бұл шаттл-векторды пайдалану арқылы, ацетоацетатдекарбоксилаза
(adc) мен фосфотрансбутирилаза (ptb) гендері C. acetobutylicum ATCC 824 табысты жоғарғы деңгейде
көрсетілуі мүмкін. Кең қолданыстағы плазмид C. Acetobutylicum көшірмелер саны жасушаға шамаен
7-20 көшірмені құрайды, метаболиттік инженерия міндетіне сай келетін болып табылады [59].
Гендер нокаутының тиімді жүйесінің жоқтығынан клостридий метаболиттік инженериясы қиын. C.
acetobutylicum өте төмен жаңғыртылумен бес қана ген нокаутдалды viz-buk, pta, adhE, solR, spo0A
[42, 60]. Хип және бірлескен авторлар (2007), клострон жүйесі деп аталатын, Lactobacillus lactis
пайдаланумен, гендер нокаут жүйесін ойлап тапты [61]. Бүгінгі таңда, клостридий үшін бұл ең тиімді
гендер нокаут жүйесі.
Метаболиттік инженерияның бірінші табысты ерекшелігі C. acetobutylicum ацетонның түзілу
жолын күшейту болды. C. acetobutylicum пайдаланумен күшейтілген гендермен adc и ctfAB
(ацетоацетатдекарбоксилазаны кодтайтын және CoA трансферазды, сәйкесінше) рекомбинанттау
ретінде ферменттеу кезінде, ацетон құраушы гендер ертерек белсендіріледі, ол ацетонның бұрынғы
индукциясына әкеледі. Ата-аналық штаммды қолданумен ферменттеуден айырмашылығы, бұл
процесс ацетонның, бутанолдың және этанолдың соңғы концентрациясының 95%, 37% және 90%,
сәйкесінше, көбеюіне әкелді [62]. Басқа зерттеуге сәйкес, бутираткиназ бен фосфор трансацетилаз
кодтайтын, сәйкесінше, buk и pta гендері, көміртек ағынын қышқыл түзілуден еріткіш түзілгенге
қайта бағыттау үшін демобилизацияланды.
Әсерсіздеу buk гені бар, штамм PJC4BK бас штаммға қарағанда, бутанолды 10% -ға көп өндірді
[63]. Сонымен қатар, C. acetobutylicum бутират түзуші ферменттердің белсенділігін төмендету үшін
РНК (асРНК) қарсы мағыналы технология тиімді. Десаи мен Папутсакис (1999) екі түрлі асРНК
зерттеді, біреуін buk үшін, ал екіншісін ptb үшін, және бутираткиназа мен
фосфотрансбутирилазаның, сәйкесінше 85% және 70%, белсенділігін сәтті төмендетті.
Түрлендірілген buk-асРНК штамм, ацетон мен бутанолдың, сәйкесінше 50% және 35%, жоғарғы
концентрациясын өндірді. Еріткішке төзімділік және C. acetobutylicum күйзелуге жауап реакциясы
көптеген гендердің гипер экспрессиялануы арқасында, молекулалық сорғыларды, споруляция, майлы
қышқылдарды синтездеу мен транскрипция реттегіштеріне қатысатын, шаперондар (мысалы, groES,
dnaKJ, hsp18) мен гендерді қосып алғанда, жақсаратылуы мүмкін [64]. Жылу соққысына GroES және
GroEL қарсы ақуыздардың жоғарғы дәрежесі, сол сияқты еріткіш ферменттерді тұрақтандыру
173
арқылы еріткіштердің соңғы концентрациясын үлкейтеді [65].
2007 жылға дейін C. acetobutylicum геномының толық тізбегі қолжетімсіз болды, нәтижесінде
қышқылдар немесе еріткіштердің түзілуімен тікелей байланысатын гендермен, технологиялық
мақсаттар шектеулі болды. Енді, геномның толық тізбегіне қолжетімді болғанда, штаммды
жақсартуға жүйелі процесс жүргізуге болады. Биология жүйесі саласындағы жетістіктер көмегімен,
компьютерлік модельдеу мен ынталандыруды да тиімді құрал ретінде, метаболиттік жол үшін
клостридий инженериясында қолданылуы мүмкін. Іс жүзінде, Папутсакис (1984), C. acetobutylicum
метаболиттік ағындардың сандық анализі үшін стехиометрикалық модель сияқты шығарғандардың
ішінде бірінші болды [66].
Сондай-ақ, бутанол өндірісіне ішек таяқшаларының метаболиттік инженериясы үшін құралдарды
әзірлеуге күш жұмсалды. C. acetobutylicum бактериялар мен atoB E.coli гендердің, мутантты штамм
E.Сoli BW25113, гиперэкспрессиялаушы гендер crt, bcd, etfAB, hbd және adhE2, көміртек көзі ретінде
2%-ды (мас./об.) глицерин қолданумен 552 мг/л бутанол қндіруге қабілетті [67]. Бутанол синтезіне
қатысатын гендердің гипер экспрессиясы кезінде thl, hbd, crt, bcd, ald және bdhA B C. acetobutylicum,
0,8 мМ, 0,19 мМ және 0,01 мМ бутанол E. coli, B. subtilis және S. cerevisiae, сәйкесінше, алынуы
мүмкін [68].
Достарыңызбен бөлісу: |