Результаты и обсуждение. В середине 2000-х годов был предложен новый класс
мишеней для блокировки — аминоацил-тРНК-синтетазы (АРСазы). Иначе говоря, было
обнаружено, что некоторые бактериальные (прокариотные) АРСазы зачастую довольно
сильно отличаются от эукариотных, и, в частности, человеческих, аналогов.
АРСаза — фермент-синтетаза, катализирующий образование связки аминокислоты с
тРНК перед встраиванием последней в синтезируемый белок. АРСазы обеспечивают
правильность происходящего в дальнейшем считывания генетической информации с
мРНК при синтезе белков на рибосомах. Для каждой аминокислоты существует своя
аминоацил-тРНК-синтетаза.
К туберкулезу искатели антибиотиков-ингибиторов АРСазы до сих пор не
подобрались во многом потому, что не были получены кристаллические трехмерные
структуры этих ферментов, то есть было не совсем понятно, по каким признакам
определять потенциальные лекарства. Однако первичная структура (последовательность
аминокислот в белке) у некоторых туберкулезных АРСаз, в частности у лейцил-тРНК-
синтетазы (ЛРСаза) была известна, также было известно, какие именно аминокислоты
находятся в активном центре. Ученые из Института молекулярной биологии и генетики
УАН (Киев, Украина) и OtavaLtd. (Вон, Онтарио, Канада) решили использовать
имеющуюся информацию довольно оригинальным образом.
Трехмерная структура и точное строение активного центра были известны у
другой бактериальной ЛРСазы, принадлежащей грамотрицательной бактерии
Thermusthermophilus. Аминокислотные последовательности ЛРСаз Mycobacterium
tuberculosis и T. thermophilus имеют всего лишь 37-процентное сходство, однако
непосредственно в активном центре их сходство — 95%, в то время как с
аминокислотными последовательностями активного центра человеческой ЛРСазы
сходство минимально.
Таким образом, используя структуру ЛРСазы T. thermophilus как шаблон,
исследователи построили модель ЛРСазы M. tuberculosis. Теперь в бой вступила