Репликация днк: учебное пособие

Document Outline

• Введение
• Глава 1. Репликация – полимеразная реакция
  • 1.1. Вилка репликации
• Глава 2. Начало репликации
  • 2.1. Понятие о репликоне и ориджине репликации
  • 2.2. Ориждин репликации E.coIi oriC
  • 2.3. Ориджины других организмов
  • 2.4. Скорость репликации
• Глава 3. Инициация репликации
  • 3.1 Инициация репликации у E.coli
  • 3.2. Инициация репликации у эукариот
• Глава 4. Механизм образования и необходимость РНК-праймера
  • 4.1. Синтез праймера для полимеразной реакции
  • 4.2. Понятие об РНК-ДНК дуплексе
  • 4.3. Ключевые ферменты, участвующие в синтезе ДНК
    • 4.3.1. ДНК-полимеразы
      • 4.3.1.1. ДНК-полимеразы прокариот
      • 4.3.1.2. ДНК-полимеразы эукариот
      • 4.3.1.3. ДНК-полимераза α – праймаза
      • 4.3.1.4. Реакция праймирования
      • 4.3.1.5. ДНК-полимеразы δ и ε
      • 4.3.1.6. ДНК-полимераза γ
      • 4.3.1.7. ДНК-полимераза β
    • 4.3.2. Ферменты репликативного комплекса
      • 4.3.2.1. Факторы репликации
      • 4.3.2.2. Эндонуклеазы. FEN-1
      • 4.3.2.3. ДНК-лигазы
      • 4.3.2.4. Геликазы
      • 4.3.2.5. ДНК-топоизомеразы
• Глава 5. Терминация репликации
  • 5.1. Завершение репликации у E.coli
  • 5.2. Завершение репликации у эукариот. Теломеры
    • 5.2.1. Понятие о теломерах
    • 5.2.2. Строение теломер
  • 5.3. Теория недорепликации теломер
    • 5.3.1. Репликация теломер и поддержание их длины в клетках полового пути
  • 5.4. Белки теломерного комплекса у человека
    • 5.4.1. Теломеры дрожжей
  • 5.5. Теломеры и репарация
  • 5.6. Функции белков, связанных с теломерами
  • 5.7. Теломеры и старение
  • 5.8. Теломеры и рак
• Глава 6. Клеточный цикл у эукариот
  • 6.1. Понятие о клеточном цикле
  • 6.2. Стадии клеточного цикла
  • 6.3.Регуляция клеточного цикла у эукариот
    • 6.3.1. Белки-ингибиторы комплексов циклин-зависимых киназ с циклинами
    • 6.3.2. Регуляция активности CDKS фосфорилированием
    • 6.3.3. Деградация циклинов в клеточном цикле
  • 6.4. Точка рестрикции клеточного цикла – узел митогенных и ингибирующих сигналов
    • 6.4.1. Точка рестрикции и G1-чекпойнт
    • 6.4.2. Остановка деления или пролиферация?
  • 6.5. Координация ядерных и цитоплазматических процессов во время клеточного цикла
• Глава 7. Пострепликативные модификации ДНК
  • 7.1. Метилирование ДНК
    • 7.1.1. Цитозин(С5) – ДНК-метилтрансферазы эукариот
      • 7.1.1.1. Семейство Dnmt1
      • 7.1.1.2. Семейство Dnmt2
      • 7.1.1.3. Семейство DnmtЗ
  • 7.2. Регуляция экспрессии и модуляция активности метилтрансфераз
• Глава 8. Протеасомная деградация белков и ее роль в регуляции процессов ДНК-метаболизма
  • 8.1. Структура 26S протеасомы
    • 8.1.1. Структура 20S протеасомы
    • 8.1.2. Образование 26S протеасомы
  • 8.2. Система убиквитинирования
    • 8.2.1. Субстраты 26S протеасомы
  • 8.3. Роль протеасомы в регуляции клеточного цикла
  • 8.4. Роль протеасомы в представлении антигенов комплекса МНС (Major complex of histocompatibility)
  • 8.5. Механизмы регуляции активности протеасомы
  • 8.6. Основные субстраты протеасомы
• Глава 9. Рекомбинация ДНК: связь с репликацией и репарацией
  • 9.1. Роль двунитевых разрывов ДНК в процессе рекомбинации
  • 9.2. DSBs и процесс репликации
  • 9.3. Репликация, индуцированная разрывами. BIR (break induced replication)
  • 9.4. Генная конверсия
  • 9.5. Захват репарационно-репликационной вилки
  • 9.6. Генетическая характеристика вовлеченных в гомологическую рекомбинацию белков-гомологов RecA
  • 9.7. Биохимические свойства белков гомологической рекомбинации
  • 9.8. Наблюдение рекомбинации in vivo
• Заключение
• Список литературы