Репликация днк: учебное пособие
Ключевые ферменты, участвующие в синтезе ДНК
жүктеу/скачать 2,57 Mb. Pdf көрінісі
|
Спивак И.М. - Репликация ДНК учебное пособие - 2011
|
4.3. Ключевые ферменты, участвующие в синтезе ДНК Многие известные теперь детали процесса репликации ДНК удалось установить бла- годаря исследованию поведения и активности ферментов, обеспечивающих работу аппарата репликации. Наиболее полно изучен механизм репликации бактериальной ДНК, особенно ДНК Е. соli и бактериофагов, которые в ней размножаются. Довольно хорошо известны и ферменты репликации дрожжей, Drosophila, млекопитающих. 4.3.1. ДНК-полимеразы ДНК-подимсразы присутствуют во всех прокариотических и эукариотических клет- ках. Более того, многие вирусы бактерий и животных индуцируют образование вирус-специ- фических ДНК-полимераз или белков, способствующих эффективному участию ДНК-поли- мераз клеток-хозяев в репликации вирусной ДНК. Многие прокариотические и эукариотические ДНК-полимеразы выделены в чистом виде, а их физические и ферментативные свойства детально охарактеризованы. И хотя эти свойства не совсем идентичны, механизм катализа для всех указанных ферментов в общих чертах одинаков. Рис. 11. Общий принцип строения ДНК-полимераз. В первичной структуре ДНК-полимераз эукариот присутствуют консервативные мотивы, гомологичные соответствующим мотивам прокариотических ферментов. Это под- тверждает, что все ДНК-синтезирующие ферменты имеют общий план строения. Общий принцип строения ДНК-полимераз показан на рис. 11. По форме ДНК-полимсразы можно уподобить полураскрытой кисти правой руки, в которой ладонь, большой палец и осталь- ные пальцы представляют три основных пространственных домена и формируют полость, И. М. Спивак. «Репликация ДНК: учебное пособие» 33 удерживающую ДНК-матрицу и затравку в ходе синтеза. Консервативные мотивы А, В и С образуют активный центр в домене «ладони», «пальцы» удерживают однонитевую матрицу, а «большой палец» прижимает праймер – матричный двунитевой участок. Применительно к различным типам ДНК-полимераз эукариот эта модель может быть модифицирована. ДНК-полимеразы работают совместно с различными белковыми комплек- сами, удерживающими их в вилке репликации. Чаще всего их называют «зажим» и «загруз- чик зажима» («sliding clamp», «clamp loader»). Рис. 12. Загрузка ДНК-полимеразы После объединения ДНК-полимеразы с зажимом, «загрузчик зажима» отходит от места реакции, но держится поближе к отстающей нити, чтобы провести загрузку на новом месте объединения праймер-матрица, как только ДНК-полимераза диссоциирует при завер- шении синтеза предыдущего фрагмента Оказаки. Этот процесс схематически изображен на рис. 12. Подробно об этих комплексах у эукариот и их роли в репликации будет рассказано далее. жүктеу/скачать 2,57 Mb. Достарыңызбен бөлісу:
|