Ветеринария факультеті
жүктеу/скачать 29,19 Kb.
|
Жұман Ернар ВМ405 генетика
| II.Негізгі бөлім
2.1. LTF генінің полиморфизімі. Лактоферрин-трансфериндер классынан шыққан полифункционалды ақуыз. Лактоферрин шамамен 80 кДа молекулалық массасы бар глобулярлық гликопротеин болып табылады және сүт, сілекей, жас, мұрын бездерінің құпиясы сияқты әртүрлі секреторлық сұйықтықтарда кеңінен ұсынылған.Лактоферрин ағзаның иммундық жүйесінің компоненттерінің бірі болып табылады, спецификалық емес гуморальді иммунитет жүйесіне қатысады, иммунокомпетенттік жасушалардың қызметін реттейді және қабынудың жіті фазасы болып табылады. LTF гені 22q24 храмасомасында орналасқан, 34,5 мың геннен құралған 17 экзоннан тұрады. Голштин тұқымдас сиырларда геннің жиілігі АА, ВВ және АВ локтоферин 32,5%, 10% және 57,5% таралу жиілігі. LTF генінің полиморфизімін анықтау үшін F-5' –GCCTCATGACAACTCCCACAC-3’, R -5'-CAGGTTGACACATCGGTTGAC-'. Жүргізілу шарттары денатурация 94 С 45 сек, праймерлердің жабысуы 62 С 45 сек, элонгация 72 С 45 сек және йиклдердіңсаны 35-40 Ақуыз ДНҚ және РНҚ, полисахаридтермен, гепаринмен өзара әрекеттеседі, және де өзінің биологиялық функцияларының кейбірі лактоферрин осы лигандармен кешен түрінде көрінеді. Лактоферрин генінің полиморфизмінің LTF маститпен сырқаттанушылығымен және сүтқоректілердің сүттегі соматикалық жасушаларының құрамымен тығыз байланыс орнатылған. Лактоферрин генінің өнімдері бірқатар ауруларға, ең алдымен маститке төзімділікпен байланысты. Лактоферрин LTF сүттің көпфункционалды шағын гликопротеині, оның негізгі функциясы сүт безін қорғау. Сүттегі соматикалық жасушалардың құрамын және мастит ауруын болжау үшін ДНК-маркер ретінде лактоферриннің генетикалық нұсқаларын қолдануға болады деп саналады: а гена аллеясы LTF сиырлар сияқты сүтқоректерде мастит ауруымен байланысты. Сондай-ақ қойлардағы ВМР 15 және GDF9 гендерінің полиморфизмінің овуляцияланатын фолликулдардың санына және овуляция деңгейіне әсері анықталды. Мысалы, ген аллелиі, қойда Bone morphogenetic protein ВМР 15, фолликулогенез процесіне және гетерозиготты қойлар осы бұйра бойынша екі-үш ооциттермен овуляцияланады. Осы зерттеудің авторлары қой шаруашылығында жануарлардың құнарлылығын арттыру үшін қойдың ДНК маркер ретінде ВМР 15 генінің полиморфизмін қолдануды ұсынады. GDF9 генінің өнімдері сиырларда фолликулдардың өсу және даму процесін бақылайды. Бұл геннің полиморфизмі медицинада жақсы зерттелген, gdf9 генінің кодтау бөлігінде мутациясы бар әйелдерде аналық без функциясының уақытынан бұрын сіңу белгілері бар. Лактоферрин генінің полиморфизмін зерттеу теориялық және қолданбалы мәнге ие, өйткені сүттегі соматикалық жасушалардың құрамы мен лактоферриннің генетикалық нұсқалары арасында оң корреляция бар. Осылайша, жұмыс авторлары сүтқоректілердің репродуктивті қызметін болжау үшін сиырларда GDF9 генінің полиморфизмін маркер ДНК ретінде пайдалануды ұсынады. Жұмыс мақсаты: LTF, GDF9 гендерінің ДНҚ полиморфизмін зерттеу және жаңа фармакологиялық құралдарды іздеу үшін перспективалы үлгі ретінде зерттелетін локустар бойынша қажетті генотипі бар жануарларды анықтау. Ірі қара геномында SNP жалпы саны шамамен 10 миллион. Полиморфизмдер гендердің экспрессиясы мен реттелуінің бұзылуына және функционалды қасиеттері өзгерген ақуыздардың пайда болуына әкелуі мүмкін. SNP скринингі әртүрлі мультифакторлық ауруларға тұқым қуалайтын бейімділікті анықтауға, сондай-ақ фармакологиялық препараттарға жеке сезімталдықты болжауға мүмкіндік береді."SNP-Скрин" реагенттерінің жиынтығы нақты уақытта ПЦР әдісімен бірнуклеотидті полиморфизмдерді анықтауға арналған. Реагенттердің әрбір жиынтығында зерттелетін полиморфизмнің екі аллеяларын анықтауға мүмкіндік беретін екі аллель-ерекше зонд қолданылады."SNP-Скрин" жинақтарымен SNP детекция принципі"Біздің жиынтықтарымыздың негізгі элементі-флуоресценцияның екі арнасында ПТР-РВ өнімдерін бөлек анықтауға мүмкіндік беретін ерекше зондтар-аллель жұбы болып табылады. Екі арнадағы реакция нәтижелері зерттелетін полиморфизм аллеяларының әрқайсысын анықтауға мүмкіндік береді. Біздің зондтар реакция температурасында оңтайлы рұқсат пен сигнал деңгейін алуға мүмкіндік береді. Бұл арнайы алгоритмдерді пайдалана отырып, егжей-тегжейлі іріктеумен, модификацияларды бірізділікке енгізумен, нақты рұқсат ету қабілетін бақылаумен қамтамасыз етіледі.
жүктеу/скачать 29,19 Kb. Достарыңызбен бөлісу:
|