Ақпеттау болысында туған. 1882 жылы Омбыда мұғалімдер семинариясын бітірді. Сол жерде ол гимназияда сабақ берді. 1883-1889 жылдары Семей облысының әскери губернаторы кеңесінде аудармашы, аса маңызды істер жөніндегі шенеунік. 1885 жылы мамырда сотталған "Семей облысының қазақтары үшін қылмыстық істерге қарсы заңнамалық актілерді"[нақтылау] әзірлеуге қатысты. 1889-1894 жылдары Томск университетінің медицина факультетінде оқыды. Қарқаралы және Павлодар уездерінде, Өскемен уезінің Большенарым кентінде дәрігер. 1917 жылғы төңкерістен кейін жергілікті кеңестің төрағасы, Өскемен уездік Кеңесі атқару комитетінің мүшесі болды. "Алаш" партиясының көрнекті қайраткері болды. Ол 1919 жылдың күзінде іш сүзегінен қайтыс болды.
Бұл адамға соншалықты мұқият назар аудару оның ерекше тұлға болғандығына байланысты. Бұл туралы әскери губернатор Котюхов қол қойған 1889 жылғы 23 қаңтардағы жұмыстан босату туралы бұйрықта былай делінген: "әскери губернатор жанындағы арнайы тапсырмалардың Кіші шенеунігі колледж хатшысы Айтбакин жоғары білім алуға ұмтылып, өзінің жаңадан ашылған Томск университетіне түсуін ұйымдастыру үшін оған рұқсат етілген екі айлық демалысты пайдаланды. Айтбақин мырзамен қоштасып, оған қызметтік тапсырмаларды, әсіресе облыстық қатысудың шаруашылық бөлімін басқару жөніндегі тапсырмаларды мұқият және адал орындағаны үшін алғыс айтамын".
Қазақ дәрігерінің өмірбаянын ресейлік зерттеушілер де осындай жарияланымды іздеді. "Сібір хабаршысы" газеті былай деп жазды: "жаңа оқу жылының басында Томск университетінің студенттері арасында біз көптеген Сібір бөтен тайпаларының біріне жататын жас жігітті көреміз. Бұл жас жігіт өте жақсы білім алып, мемлекеттік қызметте болды және жақсы әлеуметтік жағдайға ие болды. Қызметін жалғастыра отырып, ол жақын болашақта өзінің жағдайын және жақсы материалдық қамтамасыз етуді біртіндеп жақсартуға сенуге толық құқылы болды. Алайда Томск университетінің ашылуы оның барлық бастапқы жоспарларын өзгертті және оның кейінгі өміріне шешуші әсер ететін сияқты.
Өз руларының қажеттіліктерін біле отырып және оларға айтарлықтай пайда әкелгісі келіп, ол мемлекеттік қызметті тастап кетуге бел буды және облыстық әкімшілікте көрнекті орындардың бірін иеленген шенеуніктен кішіпейіл студентке айналды. Оның барлық армандары-университетті бітіргеннен кейін кедей және дамымаған көшпелі тайпаларға оралу және олардың пайдасына өмірінің ең жақсы жылдарының жартысына жуығы алатын білімін пайдалану. Оны есептеу өте дұрыс. Дәрігердің білімімен оралғаннан кейін, ол өзінің туыстарына шенеуніктің жағдайына қарағанда салыстырмалы түрде моральдық әсер етуі мүмкін. Бірінші жағдайда, ол жақсы көреді және құрметтеледі, ал оның дауысы бүкіл тайпаның тағдырына әсер етуі мүмкін, оның саны жүздеген мың адамнан асады; екіншісінде, ол тек құрметтелетін, мүмкін, оның позициясына қызғанышпен қарайтын, бірақ сонымен бірге олар қорқып, бейтаныс адам болып саналатын еді. Жас шетелдіктің әкімшілік мансабын студент-жұмысшының қарапайым үлесіне айырбастағанын, әрине, туған ұясына деген сүйіспеншілік пен адалдықтың асыл сезімін, туған халқының игілігі үшін жанқиярлықты көрсетуден басқа ештеңемен түсіндіруге болмайды".
Әли Әміре Айтбақин 1860 жылы қазіргі Павлодар облысының Ақпеттау болысында дүниеге келген. 1882 жылы ол Омбы мұғалімдер семинариясын сәтті бітіріп, Омбы әскери гимназиясына мұғалім болып тағайындалды. Содан кейін ол Дала генерал-губернаторлығының кеңсесінде қырғыз тілінің ауызша аудармашысы болды. Кейін Айтбақин Семей қаласына облыстық басқарма жанындағы қазақ тілінен аудармашы болып ауыстырылды. 1886 жылы 1 мамырда Қарқаралы уездік бастығының аға көмекшісі лауазымында бекітілді. Үкімет Сенатының 1886 жылғы 22 желтоқсандағы Жарлығымен А. Д. Айтбақин еңбек сіңірген жылдары колледж хатшылығына еңбек сіңірген. Бірақ мұнда ол әрі қарай оқуға, Императорлық Томск университетінің медицина факультетіне оқуға түсіп, дәрігер болуға шешім қабылдады. Мен бұл Сібірдегі алғашқы университет тарихындағы екінші жиынтық болғанын атап өтемін.
Сақталған мәліметтерге сәйкес, алғашқы кезде оған оқу қиынға соқты, өйткені оқуға түсу кезінде бірінші курс студенті 30 жаста еді. Бірақ дәрігер болуға деген үлкен желылас болды. Сондықтан Әміре сол кездегі атақты профессорлар – М.Г. Курлов, Э. г. Салищев, А. и. Судаков, П. В. Буржинский, С. и. Залесский және басқалардың дәрістерін үлкен қызығушылықпен тыңдады. Болашақ профессорлар мен медицина докторлары Н. В. Вершинин, В. Д. Добромыслов, н. с. Касторский, н. с. Спасский онымен бір курста оқыды. Әміренің күш-жігері мен қабілеттері нәтиже берді: емтихандарда қазақ студенті жақсы баға алды (мұндай оқуы үшін Павлодар уездік бастығының стипендиясына ие болды), ал төртінші курста Айтбақин университеттің гигиеналық зертханасында өткізілетін жыл сайынғы студенттік шығармалар (зерттеулер) байқауында күміс медальмен марапатталды. Онда Баянауылдың тумасы қымыстың емдік қасиеттерін және оны сақтауды – "зарарсыздандыру кезіндегі қымыз өзгерісін және зарарсыздандырылған қымыз құрамын" зерттеді. Бұл жұмыс университеттің жетекші профессорларының мақұлдауына ие болды.
Томск университетінің медициналық сынақ комиссиясында емтихан тапсырғаннан кейін А. Айтбакин 1894 жылы 19 қазанда дәрігер дәрежесіне ие болды. Көп ұзамай, замандастарының пікірінше, ол дала дәрігері және данышпан ретінде кеңінен танымал болды. Ол туралы ақпарат Баян ауылынан Қарқаралыға, содан кейін Семей, Иркутск, Томск қалаларына тарап, ақыры Мәскеуге жетті.
Алғашқы дәрігер-қазақ туралы газеттердің бірінде былай деп жазылған: "Қарқаралыда оның қабылдауын көрген және осы" өзінің " дәрігері туралы халық ауыздан шыққан Сөзіне құлақ асқан адамдардың әңгімелері бойынша ол зор беделге ие және өз уезінің қырғызына ықпалын тигізеді. Күн сайын сіз оның пәтеріне жақын жерде жүздеген Атқа мінген қырғыздарды көре аласыз, олар оған округтің әр түкпірінен тек аурулары туралы ғана емес, жалпы өз істері, ауыр, отбасылық және басқа да мәселелер бойынша кеңес алу үшін келеді. Бұл мысалда шетелдіктерді жалпыеуропалық мәдениетке баулу үшін баратын шынайы жол жақсы көрінуі мүмкін".
"Қырғыз дала газеті" Өскемен уезінің хат-хабарларында былай деп жазды: "биыл біздің уезге 3-ші учаскенің дәрігері Айтбақин тағайындалды. Бұл қырғыз дәрігерінің бірінші рет тағайындалуы. Қырғыз халқы жаңа дәрігерге үлкен охыласпен жүгінеді, бұл Айтбакиннің жеке қасиеттерінен басқа, оның аудармашының көмегінсіз науқаспен ана тілінде түсіндіре білуіне көп ықпал етеді. Қырғыздар бұрынғы дәрігерлерге, орыстарға көмек сұрап, түсініксіз қорқыныштан, орыс тілін білмегендіктен келді. Айтбақин мысалында қырғыздар ағартушылықтың пайдасына көз жеткізіп, адамдардағы туу мен байлықты ғана емес, білім беруді де ажыратуға үйренеді".
Томск университетінің ректоры, профессор А. и. Судаков 1898 жылы бір жылдық актіде баяндама жасай отырып, университеттің үй жануарлары арасында А. Айтбакинді атады, олар " Сібірдің шалғай жерлерінде жұмыс істей отырып, сол халыққа тек арнайы білімдерімен ғана емес, сонымен бірге осы
халықтың дамуына және басқа да тараптарға ықпал етеді мәдениеттер". Ғалымның мұндай мойындауына лайық болу керек еді!
Көп ұзамай Әміре Айтбақин Павлодар уезіне 3-ші учаскенің дәрігері болып ауыстырылды, бірақ ол Қарқаралы уезінің 1-ші учаскесінің дәрігері болып қала берді. 1901 жылдың 10 сәуірінен бастап А. Айтбақин-Өскемен уезінің 3 учаскесінің және Зайсан уезінің 2 учаскесінің дәрігері.
Бірақ бұл адам қазақстандық және ресейлік ғалымдардың зерттеулері бойынша қоғам қайраткері ретінде де танымал болған. Ол өзінің мақалалары мен жазбаларын "Дала уалаятын газет" (1888-1902) газетінде жариялады. Ш.Құдайбердиев пен А. Байтұрсыновпен бірге қазақтар арасында әлеуметтік маңызы бар қоғамдық идеялардың таралуына ықпал етті. Сонымен қатар, А. Айтбақин Семей облыстық Статистика комитеті жанындағы музей жұмысына қатысып, түрлі экспонаттарды тапсырды.
Дәрігер өзін "Алаш"партиясының көрнекті қайраткері ретінде көрсетті. Ол 1917-1919 жылдардағы революциялық кезеңді Өскеменде өткізді, бірнеше рет бір-бірін алмастыратын барлық билік орындарында әртүрлі лауазымдарды атқарды, тіпті Өскемен земство уездік басқармасының төрағасы болып сайланды. Шамасы, Амре Айтбакин 1919 жылдың күзінде іш сүзегінен қайтыс болды. Бұл алғашқы қазақ дәрігері Императорлық Томск университетінің медицина факультетінің үй жануарларының өмір жолы болды.