Қазақстан республикасы білім жəне ғылым министрлігі м. Ж. Еркебаев, Қ. С. Құлажанов, Д. Б. Тəттібаева, А. Ы. Мəуленов


1- кезең Денатурация (93-95 0 С) 2- кезең Праймерлерді күйдіру (50-65 0 С) ДНҚ



Pdf көрінісі
бет35/111
Дата21.06.2023
өлшемі1,24 Mb.
#102821
түріОқулық
1   ...   31   32   33   34   35   36   37   38   ...   111
62
1- кезең
Денатурация (93-95
0
С)
2- кезең
Праймерлерді күйдіру (50-65
0
С)
ДНҚ-ның ізделіп отырған фрагменттері
3- кезең
ДНҚ тізбегінің синтезі
(72
0
С)
4-сурет. Амплификация циклі
ДНҚ-ның ізделіп отырған фрагментінің көшірмесін жеткілікті 
мөлшерде алу үшін амплификацияның 20-40 циклін жүргізеді. 
Амплификацияның бірінші циклінде түзілген ДНҚ-ның жаңа тізбектері 
екінші цикл үшін матрица қызметін атқарады, екінші циклде де ампли-
кон деп аталатын ізделіп отырған ДНҚ-ның спецификалық фрагменті 
түзіледі. Амплификацияның келесі циклдерінде ампликондар жаңа 
тізбектерді синтездеу үшін матрица қызметін атқарады (
5-сурет).


63
Осылайша, ерітіндідегі ампликондардың жинақталуы 2

формула-
сы бойынша жүреді, мұндағы, n – амплификация циклдерінің саны. 
Сондықтан егер бастапқы ерітіндіде тек бір екітізбекті ДНҚ молеку-
ласы болса, 35 цикл ішінде ерітіндіде теориялық түрде ампликонның 
30 млрд-тан астам молекуласы жинақталуы тиіс. Агарозды гельде 
фрагментті электрофорез əдісімен визуалды түрде анықтау үшін осы 
мөлшер жеткілікті болады.
Шын мəнінде, амплификацияның жекелеген циклдерінің 
тиімділігі кейбір мəліметтер бойынша 78-97% құрайды. Сынамада 
реакция ингибиторлары болса, бұл мəн едəуір төмен болуы мүмкін, 
амплификацияның спецификалық өнімдерінің шынайы санын:
А = М(1+Е)
п
,
теңдеуі бойынша дəлірек анықтауға болады.
Мұндағы, 
М – ДНҚ-нысаналарының бастапқы мөлшеріn –ам-
плификация циклдерінің мөлшері;
 Е – реакция тиімділігі.
ДНҚ-ның
ізделіп отырған бөлімі
5-сурет. Амплификация өнімдерінің экспоненциалды 
түрде жинақталуы
Амплификация процесінде, бастапқы тізбектегі ұзын фрагмент-
тер де синтезделеді, бірақ олардың жинақталуы тек арифметикалық 
прогрессияда: 


64
К=Мп
формуласымен жүреді
Мұндағы, 
К-амплификацияның ұзын өнімдерінің санып-циклдер 
саны.
Осылайша, соңы праймерлермен шектелген спецификалық фраг-
менттер алғаш рет екінші цикл соңында пайда болады, геометриялық 
прогрессияда жинақталады жəне кейінірек амплификация өнімдері 
арасында басымдықты иеленеді.


Достарыңызбен бөлісу:
1   ...   31   32   33   34   35   36   37   38   ...   111




©emirsaba.org 2024
әкімшілігінің қараңыз

    Басты бет