"фараби əлемі" атты халықаралық ғылыми конференция материалдары

179 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
4 СЕКЦИЯСЫ 
БИОТЕХНОЛОГИЯНЫҢ ҚАЗІРГІ ЗАМАНУИ 
МӘСЕЛЕЛЕРІ 
 
 
СЕКЦИЯ 4 
ПРОБЛЕМЫ СОВРЕМЕННОЙ 
БИОТЕХНОЛОГИИ 
 
SECTION 4 
ISSUES IN MODERN BIOTECHNOLOGY 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 

180 
 
miRNAS AND POU5F1, SOX2 GENES AS POTENTIAL PARTICLES FOR INCORPORATION 
INTO POLYSACCHARIDE 
 
Aisina D.E., Akimniyazova A.N., Shokatayeva D.H., Talipova A.B., Kuli Zh.T. 
al-Farabi Kazakh National University 
dana.aisina03@gmail.com
 
 
POU5F1 and SOX2 genes encode the transcription factors that are involved in oncogenesis, including 
the  development  of  breast  cancer.  In  particular,  SOX2  inhibits  cell  proliferation  and  metastasis,  promotes 
apoptosis.  For  delivery  to  the  tumor  POU5F1  and  SOX2  genes  included  in  negatively  charged  plasmid 
mixture,  used  in  the  positively  charged  cationic  polysaccharide  self-organizing  into  nanosized  particles, 
named  as  CPEPS-OS-miR  nanoparticles,  which  can  be  applied  in  oncological  medicine.  In  these  particles 
included miR302-367, which can bind to mRNA genes. To test the effectiveness of microRNAs, we detected 
microRNAs that can suppress the expression of POU5F1 and SOX2 genes. 
The  nucleotide  sequences  of  mRNAs  of  human  genes  were  downloaded  from  NCBI  GenBank 
(http://www.ncbi.nlm.nih.gov).  Nucleotide  sequences  of  human  2565  miRNAs  were  downloaded  from  the 
miRBase database (http://mirbase.org). miRNAs binding sites were predicted using the MirTarget program.  
There are ten miRNAs bind with mRNAs of PO5F1 gene from 512 nt to 625 nt position with binding 
energy of -91 kJ/mole to -119 kJ/mole in 5’UTR, another cluster of miRNAs with mRNAs of  PO5F1 have 
been  in  position  from  1000  nt  to  1433  nt  in  5’UTR.  Notably,  miRNAs  with  mRNAs  of  SOX2  gene  have 
binding  sites  in  3’UTR,  and  have  positions  from  1672  nt  to  1681  nt, creating  a  cluster for eight  different 
miRNAs with binding energy of  -98 kJ/mole to  -108 kJ/mole, and they have score from 85% to 89%. The 
obtained results indicate that mRNAs of POU5F1 and SOX2 genes can bind to miRNAs in different degrees. 
The  largest  number  of  miRNAs  binding  sites  was  shown  for  mRNA  of  SOX2  gene,  than  for  POU5F1. 
miR302-367 do not interact with mRNAs of POU5F1 and SOX2 genes. Based on the obtained data, miRNAs 
and mRNAs of POU5F1 and SOX2 genes associations have been identified, that allows them to be used as 
potential particles for incorporation into polysaccharide for further use in cancer medicine. 
  Scientific adviser: Doctor of biological sciences, Professor A.T. Ivashchenko 
 

жүктеу/скачать 2,79 Mb.

Достарыңызбен бөлісу: