Механизм действия ферментов. Концепции «дыбы» и «лилипутов»
06/11/23
Коваль А. Н., 2006 (C)
В 1954 году была предложена гипотеза связывающая механизм ферментативного каталитического акта с деформацией и напряжением молекулы субстрата при ее сорбции в активном центра фермента.
Эта гипотеза вошла в науку под названием концепции «дыбы» или «лилипутов».
Первое подчеркивало принудительный характер механической деформации гибкого субстрата жестким ферментом.
Второе название указывает на то, что слабые нековалентные взаимодействия субстрата и активного центра обеспечивают дестабилизацию субстрата и перевод его в высокоэнергетическое переходное состояние.
Механизм действия ферментов. Современные взгляды
06/11/23
Коваль А. Н., 2006 (C)
Современные концепции на механизм ферментативного катализа объединяются в теорию топохимического соответствия и объединяют все вышеперечисленные взгляды.
Структурная организация ферментов
Активные центры ферментов
Структурная организация ферментов
Аллостерический центр (или центры) (от греч. аllos - другой, иной и steros - пространственный, структурный) - участок молекулы фермента, с которым связываются определенные, обычно низкомолекулярные, вещества (эффекторы, или модификаторы), молекулы которых отличаются по структуре от субстратов.
Свойства ферментов
2а механизма действия ферментов (термодинамики катализа):
Снижение энергии активации
Снижение энтропии активации
ЕА снижается за счет образования фермент-субстратного комплекса (ЕS – комплекс Михаэлиса) за счет которого снижается энергетический барьер.
ЕА снижается за счет образования фермент-субстратного комплекса (ЕS – комплекс Михаэлиса) за счет которого снижается энергетический барьер.
Активность ферментов этого типа сильно зависит от температуры. Q10 таких реакций 2-3
