Қарапайым түрде, аутоиммунды ауру иммундық жүйенің бұзылуымен байланысты, ол дененің өзіндік тініне шабуыл жасайды. Дененің иммундық жүйесі - бұл бөтен заттар мен басқыншылардан қорғайтын мамандандырылған жасушалар мен органдардың күрделі желісі. Бөтен заттар мен басқыншылар бактерияларды, паразиттерді, кейбір рак клеткаларын және трансплантталған тіндерді қамтуы мүмкін.
