141
метода заключается в многократном копировании (амплификации)
определенных, специфических только для данной мишени участков ДНК в
процессе повторяющихся температурных циклов. На каждом цикле
амплификации синтезированные ранее фрагменты вновь копируются ДНК-
полимеразой. Благодаря этому происходит увеличение концентрации
специфических для данной мишени фрагментов ДНК в
миллионы раз, что
значительно упрощает дальнейший анализ.
Для
проведения полимеразной цепной реакции необходимо наличие в
реакционной смеси ряда основных компонентов.
Праймеры – искусственно синтезированные олигонуклеотиды,
имеющие, как правило, размер от 15 до 30 нуклеотидов, идентичные
соответствующим участкам ДНК-мишени. Они играют ключевую роль в
образовании продуктов реакции амплификации. Правильно подобранные
праймеры обеспечивают специфичность и чувствительность тест-системы.
Taq-полимераза – термостабильный фермент (максимальная активность
фермента проявляется при темп. 70-74ºС (хотя фермент может работать и при
более низких температурах). Источник происхождения этого фермента –
микроорганизм Thermus aquaticus, время полужизни при 94
С
составляет
около 45 мин. Taq-полимераза обеспечивает достраивание 3’-конца второй
цепи
ДНК
согласно
принципу
комплементарности.
Смесь
дезоксинуклеотидтрифосфатов (дНТФ) дезоксиаденозинтрифосфата (дАТФ),
дезоксигуанозинтрифосфата (дГТФ), дезоксицитозинтрифосфата (дЦТФ) и
дезокситимидинтрифосфата
(дТТФ)
–
«строительный
материал»,
используемый Taq-полимеразой для синтеза второй цепи ДНК.
Буфер – смесь катионов и анионов в
определенной концентрации,
обеспечивающая оптимальные условия для реакции, а также стабильное
значение рН.
Анализируемый образец – это
подготовленный к внесению в
реакционную смесь препарат, который может содержать искомую ДНК,
например ДНК микроорганизмов, служащую мишенью для последующего
142
многократного копирования. При отсутствии ДНК-мишени специфический
продукт амплификации не образуется.
В
идеальных условиях проведения реакции за 35 циклов ПЦР
синтезируется несколько миллиардов копий ампликона определенной длины.
Этого количества достаточно для достоверной визуальной детекции этого
фрагмента, например, с
помощью флюориметрии или методом
электрофореза в агарозном геле.
Достарыңызбен бөлісу: