Өндірістік және зертханалық жағдайларда белсенділікті сақтаумен қатар, азды-көпті ұзақ сақтау кезінде штаммның өміршеңдігін қамтамасыз ету маңызды. Ауылшаруашылық дақылдарының тіршілік әрекетін сақтаудың ең кең тараған тәсілі продуцентті жаңа қоректік ортаға мезгіл-мезгіл көшіру болып табылады. Дегенмен, бірнеше субкультуралармен продюсердің реверсиясы және белсенділігін жоғалту мүмкіндігі артады, сондықтан кез келген мутант продуцентін консервіленген түрде сақтаған дұрыс. Сонымен қатар, микроорганизмдер 10-30 жыл немесе одан да көп өміршеңдігін сақтайды. Сандық консервация тұрғысынан алғанда, 109 жасушадан тұратын популяциядан қанша жасуша сақталғаны маңызды емес - 100% немесе 0,0001%.
Температураны 0-4 °С дейін төмендету жасушаның бөлінуіне кедергі болмайды. Оны тек жасушаларды мұздату немесе сусыздандыру арқылы тоқтатуға болады. Өнеркәсіптік микроорганизмдердің көпшілігін белсенді түрде тоңазытқышта 4–6°С температурада 1–2 ай сақтауға болады. 0 ° C-тан төмен температурада жасушаның белсенділігі баяулайды, сондықтан микроорганизмдер жиі мұздатылған күйде сақталады. Бұл жағдайда аман қалу мұздату және кейінгі еріту жылдамдығына, суспензия ортасының құрамына және сақтау температурасына байланысты. Мұздату кезінде микроорганизмдердің жаппай жойылуы -15-тен -35 °С-қа дейінгі температура диапазонында байқалады. Микроорганизмдердің тіршілігі максимум, егер олар -130 ° C төмен температурада сақталса (әдетте салқындатқыш ретінде -196 ° C температурада сұйық азот қолданылады). Әдетте салқын жерде 3-5 жыл сақталғаннан кейін микроорганизмдердің тіршілігі 40-70%, 10-20 жылдан кейін 10-20% құрайды.
Микромицеттердің спораларын сақтау үшін (мысалы, лимон қышқылының продуценті Aspergillus niger) белсендірілген көмірді қолданады, оны продуценттің спораларымен (2-5) : 1 қатынасында араластырады және қоспаны 1-ге дейін кептіреді. ылғалдылығы 20-25%. Бөлме температурасында спораларды 10 жылдан астам сақтауға болады, олардың өмір сүру деңгейі 20-25% құрайды. Саңырауқұлақ дақылдары табиғи түрде немесе күштеп кептірілген қоректік субстраттарда ыңғайлы сақталады. Картоп-декстринді агарда өсірілген және бөлме температурасында кептірілген Mucor, Aspergillus, Fusarium және т.б. тұқымдас өкілдері 6–7 °С температурада тоңазытқышта 3 жыл және одан да көп өміршеңдігін сақтайды. Тарыдағы пенициллин продуценттерін өсіру және сақтау кеңінен қолданылады. Спорадан кейін тарыда өсірілген микромицеттер вакуумда кептіріліп, 4-6 °С температурада 4-5 жыл сақталады.
Спора түзуге қабілетті продуценттер спора түрінде ұзақ уақыт сақталуы мүмкін, өйткені спора ұзақ пассивті тіршілік етуге бейімделген табиғи анабионт болып табылады. Сонымен, шарап ашытқыларын сақтау үшін олар қоректік заттар жетіспейтін агарда өсіріледі. Тіршілік етудің осындай қолайсыз жағдайында ашытқы жасушаларының көпшілігі (60-80%) эндоспоралар түзеді, олар кептірілгенде 2-4 жыл бойы өміршеңдігі мен ерекше қасиеттерін сақтайды. Қазіргі уақытта микробтық дақылдарды сақтаудың ең кең тараған әдісі мұздатып кептіру болып табылады. Ол төмендетілген атмосфералық қысымдағы судың мұздатылған материалдан буға айналуынан, сұйық күйді айналып өтуінен тұрады. Әдетте микробтық культуралар 200-500 мм сын.бағ. қалдық атмосфералық қысымда -45-тен -60°С-қа дейін 1-2 сағат бойы лиофилизацияланады. тірек. Саңырауқұлақ споралары мен вегетативті бактерия жасушаларының көпшілігі мұздатылған кептірілген 15-50 жыл бойы өміршеңдігін сақтайды.