Фотоферментация-бұл фотосинтетикалық микроорганизмдердің әртүрлі тобындағы органикалық субстраттың сутекке ферментативті айналуы. Фотоферментация биосутек [60] өндірісі үшін жоғары тәуекелсіз ең тиімді режимдердің бірі ретінде ұсынылған. Бұл жұмыста биосутек өндірісін модельдеу фотоферментация әдісімен ұсынылған. Электрондар 2-фотожүйеде фотохимиялық тотығу арқылы судан бөлініп, [Fe]- гидрогеназаға өтіп, тікелей биофотолиз процесінде сутектің фотосинтетикалық түзілуіне әкеледі [61] (5- суретті қараңыз).
Сутектің микробтық өндірісінің негізгі процесі пируваттық анаэробты метаболизммен анықталады, ал пируваттың деградациясы теңдеулерде көрсетілген екі ферменттік жүйенің бірімен катализденеді.:
