"фараби əлемі" атты халықаралық ғылыми конференция материалдары
СРАВНЕНИЕ ЭФФЕКТИВНОСТИ МЕТОДОВ ИФА И ОТ-ПЦР В ДИАГНОСТИКЕ
жүктеу/скачать 2,79 Mb. Pdf көрінісі
|
| СРАВНЕНИЕ ЭФФЕКТИВНОСТИ МЕТОДОВ ИФА И ОТ-ПЦР В ДИАГНОСТИКЕ
ВИРУСНЫХ ИНФЕКЦИЙ КАРТОФЕЛЯ В РЕСПУБЛИКЕ КАЗАХСТАН Александрова А.М., Наргилова Р.М. Институт молекулярной биологии и биохимии им. М.А. Айтхожина alena_pisarenko@inbox.ru Картофель в Казахстане является основной продовольственной культурой и занимает второе место по популярности после пшеницы. Размножение картофеля вегетативным способом приводит к накоплению в клубнях большого числа патогенов и снижению общей урожайности. Основной проблемой картофелеводства являются вирусные инфекции, фенотипическое проявление которых часто отсутствует. Наиболее распространенными и вредоносными вирусами картофеля являются вирус скручивания листьев картофеля (Potato leaf roll virus, PLRV), M-, S-, X- и Y-вирусы картофеля (Potato virus M, PVM; Potato virus S, PVS; Potato virus X, PVX; Potato virus Y, PVY). Диагностика картофеля на присутствие вирусных инфекций – необходимый этап оценки и сертификации посадочного материала, технологий оздоровления картофеля, общего санитарного состояния посевных площадей. В настоящее время разработано множество методов анализа растений на наличие вирусных инфекций. Наиболее массово из них применяются иммуноферментный анализ (ИФА) и обратная транскрипция, сопряженная с полимеразной цепной реакцией (ОТ-ПЦР). Эти методы отличаются высокой чувствительностью и достоверностью полученных результатов. Мы сравнили эффективность обнаружения вирусов PLRV, PVM, PVS, PVX и PVY в образцах картофеля (167 образцов), выращенных на территориях Алматинской и Костанайской областей, 186 методами ИФА и мультиплекс ОТ-ПЦР (мпОТ-ПЦР). Вирус PLRV не был обнаружен ни в одной из анализируемых проб. Вирусы PVS, PVX и PVY эффективнее обнаруживались методом мпОТ-ПЦР (3.59, 7.19 и 4.19% против 0.6, 4.19 и 2.99% соответственно). Для PVM наиболее результативным оказался ИФА – 41.32% против 35.33% согласно мпОТ-ПЦР. PVM не обнаруживался методом мпОТ- ПЦР, если его показания на ИФА не превышали 0.4 ед. от отрицательного контроля. Возможно, это связано с особенностями нуклеотидной последовательности геномной РНК изолятов PVM, распространенных на территории Казахстана. Таким образом, для подтверждения вирусных заболеваний в полевых условиях метод ИФА предпочтительнее благодаря простоте и отсутствию необходимости использования сложного оборудования. Метод ИФА не позволяет идентифицировать различные изоляты вирусов, в этом случае использование ОТ-ПЦР предпочтительнее. Однако при работе с культурой в условиях лаборатории считаем необходимым использовать оба метода для подтверждения результатов диагностики. Научный руководитель: д.б.н., профессор Искаков Б.К. жүктеу/скачать 2,79 Mb. Достарыңызбен бөлісу:
|