Лагерьлерден тиісті органдарға жасаған көптеген мәлімдемесінің нәтижесінде және қоғам қайраткері, академик Анна Михайловна Панкратова сияқты жанашыр адамдардың көмегі арқасында Л.П.Берияның өлімінен кейін Е.Бекмахановтың ісі 1954 жылы 16 ақпанда қаралып, жабылды, ал ол өзі болды. ақталды.
Тілсіз ғалым, Гулаг лагерлерінде бастан өткерген азаптарына қарамастан, қоғамдық мұраға айналған бай ғылыми мұра қалдырды. Оңалудан кейін ол «Қазақстанның Ресейге қосылуы» жұмысын аяқтады, ол ГУЛАГ-қа дейін басталған болатын. А. М. Панкратованың баға жетпес көмегінің арқасында бұл жұмыс 1957 жылы Мәскеудің «Наука» баспасынан 30 баспа беті көлемінде жарық көрді.