"фараби əлемі" атты халықаралық ғылыми конференция материалдары

188 
 
ХАРАКТЕРИСТИКИ ВЗАИМОДЕЙСТВИЯ miRNA В 5'UTR mRNA 
ГЕНА MMP2 ЧЕЛОВЕКА И ЕГО ОРТОЛОГОВ 
 
Байжигитова Д. 
Казахский Национальный Университет им.аль-Фараби 
dianabay@mail.ru
  
 
Ген  MMP2  является  членом  семейства  металлопротеиназ  MMP  и  играет  важную  роль    в 
регуляции многих клеточных процессов. Влияние miRNA на экспрессию этого гена слабо изучено и 
требуется  установление  конкретных  miRNA  взаимодействующих    с  mRNA  гена  MMP2. 
Характеристики  сайтов  связывания    miRNA  с  mRNA  находили  с  помощью  программы  MirTarget 
которая определяла начало сайтов связывания, свободную энергию взаимодействия miRNA с mRNA 
(∆G,  kJ/mole),  отношение  ΔG/ΔGm  (%),  в  котором  ΔGm  -  свободная  энергия  связывания  miRNA  с 
полной комплементарностью участка mRNA. Установлено, что десять  miRNA могут связываться в 
5'UTR  mRNA в отрезке с 110 нуклеотида (нт) по 148 нт. Начало сайтов связывания miR-9-25082-3p и 
miR-1-1819-3p совпадали и располагались с 110 нт. Свободная энергия  взаимодействия этих miRNA 
равнялась  -121 kJ/mole и -123 kJ/mole, при величине  ΔG/ΔGm равной 85% и 86%, соответственно. С 
112 нт начинались сайты связывания miR-9-20317-3p и miR-X-48174-3p, которые взаимодействовали 
с  mRNA  с  величиной    -129  kJ/mole  и  -121  kJ/mole,  при  величине  ΔG/ΔGm  равной  87%  и  85%, 
соответственно.  Сайт  связывания  miR-17-39416-3p  начинался  с  113  нт  и  у  этой  miRNA  92% 
нуклеотидов  были  комплементарны  mRNA,  при  свободной  энергии  взаимодействия  равной  -121 
kJ/mole.  Сайты  связывания  следующуй  пары  miR-5-15733-3p  и  miR-7-20203-3p  располагались  с  115 
нт.  Свободная  энергия  взаимодействия  этих  miRNA  равнялась  -127  kJ/mole  и  -121  kJ/mole,  при 
величине  ΔG/ΔGm равной 86% и 90%, соответственно. miR-9-27797-5p имела два сайта связывания в 
5'UTR    mRNA  в  позициях  с  118  нт  и  с  124  нт.  Свободная  энергия  взаимодействия  этой  miRNA 
равнялась  -121  kJ/mole  и  -127  kJ/mole,  при  величине    ΔG/ΔGm  равной  85%  и  90%.  Наличие  двух 
сайтов связывания miR-9-27797-5p обеспечивает для нее повышенную вероятность взаимодействия с 
mRNA гена MMP2. Сайты связывания miR-12-17092-3p и miR-9-24743-3p располагались с 124 нт и с 
125 нт. Величина  ΔG/ΔGm была равной 89%, а свободная энергия взаимодействия miR-12-17092-3p 
и miR-9-24743-3p с mRNA равнялась  -123 kJ/mole и -1217 kJ/mole. Компактное расположение сайтов 
связывания нескольких miRNA облегчает сохранение их в процессе эволюции. 
Научный руководитель д.б.н., профессор А.Т.Иващенко 

жүктеу/скачать 2,79 Mb.

Достарыңызбен бөлісу: