Обострение борьбы за власть Годайго, вероятно не представлял или не обществе, которое занимали букэ. Он не выполнил чаяний поддержавших его в борьбе с Ходзё военных и тем самым не просто лишил себя сторонников, но создал благоприятные условия для претендентов на власть, главным среди которых был Асикага Такаудзи.
В 1333 г. Такаудзи создал в столице бугёсё — «секретариат» для управления городом, фактически взявший на себя функции уничтоженного рокухара тандай. Как победитель, Такаудзи по сложившейся традиции должен был вознаградить своих вассалов земельными пожалованиями и должностями сюго и дзито, но он не получил такого права от императора. Тем не менее, на протяжении 1334 г. еще продолжалось мирное сосуществование Годайго и Асикага Такаудзи. Император, объявив о своей новой политике, создавал ведомства для управления государством, а Такаудзи, не принимая участия в этой деятельности, сохранял созданное им бугёсё. Когда Годайго направил принца Норинага своим представителем в Камакура, укрепляя тем самым свою власть на востоке страны, Такаудзи послал с ним своего брата Тадаёси для обеспечения военной охраны принца.
Такаудзи не был одинок в своем стремлении к власти. Его соперниками были Нитта Ёсисада, глава мусядокоро, и принц Моринага, который оставил пост главы школы Тэндай, получил титул сэйи тайсёгун. Принц Моринага был основным соперником Такаудзи, он был героем реставрации императорской власти, его поддерживали кугэ , и он мог опереться на военную силу Нитта и Нава. Такаудзи не нашел другого способа расправы со своим основным соперником, кроме навета. Он пожаловался императору, что Моринага готовит заговор против него, и император отправил своего старшего сына под арест к Тадаёси в Камакура.
Мятеж Асикага Такаудзи В 1335 г. Ходзё_попытались вернуться к власти. Силы Ходзё Токиюки захватили Камакура, вынудив Асикага Тадаёси и принца Норинага бежать. Во время этих событий Тадаёси отдал приказ убить принца Моринага. Такаудзи, не получив императорского указа, повел свою армию в Канто и отбил Камакура. Ходзё Токиюки покончил с собой.
После этих событий Асикага Такаудзи не захотел возвращаться в столицу под предлогом опасений за свою жизнь и начал строительство дворца в Камакура. Город быстро возродился и вновь стал процветать. Тем временем Такаудзи стал распределять земли и должности в Канто, ведя себя как сегун. Когда он конфисковал земли Нитта Ёсисада и начал раздавать их своим вассалам, Годайго объявил Такаудзи «врагом трона», лишил его всех титулов и пожалований и приказал Нитта Ёсисада и Китабатакэ Акииэ восстановить императорскую власть в Канто. Однако для этого у него было явно недостаточно сил.
В начале 1336 г. Асикага двинулся на столицу и даже захватил ее, но, столкнувшись с сильным сопротивлением сторонников Годайго, через 4 дня оставил город, отступив на запад. Там он имел мало сторонников, но, умело используя недовольство самураев, а также то, что он выступал от имени отрекшегося императора Когон, сумел привлечь на свою сторону большое число буси. За поддержку он обещал им огромные пожалования: например, Хосокава — о-в Сикоку, Имагава — провинцию Биттю, Акамацу— Харима, Ники — Тамба и т.д.
В 1336 г., обеспечив себе поддержку юго-запада, Асикага Такаудзи вновь двинулся на столицу. Он разбил армию Нитта в битве при Минатогава в провинции Сэццу, после чего Нитта отступил к столице. Выступавший на стороне Годайго знаменитый воин того времени Кусуноки Масасигэ
покончил с собой на поле боя, а сам Годайго укрылся у монахов на горе Хиэй.
Такаудзи вошел в столицу вместе с принцем Ютахито, братом отрекшегося императора Когон. Ютахито был возведен на трон под именем императора Коме. Годайго объявил, что только он как обладатель истинных_ императорских регалий является законным императором, а Комё был возведен на трон с использованием фальшивых регалий. Сопровождаемый большим числом представителей аристократии и чиновников высоких рангов Годайго удалился в Ёсино. С того времени в государстве появились два двора — южный в Ёсино и северный в Киото.