Репликация днк: учебное пособие
Цитозин(С5) – ДНК-метилтрансферазы эукариот
жүктеу/скачать 2,57 Mb. Pdf көрінісі
|
Спивак И.М. - Репликация ДНК учебное пособие - 2011
|
7.1.1. Цитозин(С5) – ДНК-метилтрансферазы эукариот Цитозин(С5) – ДНК-метилтрансферазы катализируют перенос метальной группы с 3- аденозилметионина на остатки цитозина в специфических последовательностях двунитевой ДНК с образованием 5-метилцитозина и 5-аденозилгомоцистеина. Эта реакция необратима. Сравнительный анализ первичных структур прокариотических и эукариотических ДНК- метилаз позволяет отнести их к одному классу ферментов, имеющих одинаковую структуру каталитического домена. Все эти ферменты являются мономерными белками и отличаются присутствием в их структуре ряда консервативных гомологичных областей (мотивов), детер- минирующих специфические ферментативные функции. В структуре большинства цито- И. М. Спивак. «Репликация ДНК: учебное пособие» 95 зин(С5) – ДНК-метилтрансфераз присутствует до 10 консервативных участков, располо- женных в строго определенной последовательности. В результате сравнения первичных структур цитозин(С5) – ДНК-метилтрансфераз обнаружена связь каталитической функции этих ферментов с их консервативными мотивами, в то время как функция сайт-специфиче- ского узнавания связана с вариабельным участком TRD (target – recognizing domain). Ана- лиз аминокислотных последовательностей цитозин(С5) – ДНК-метилтрансфераз выявляет среди 10 консервативных блоков аминокислот четыре мотива с умеренной гомологией (II, III, V и VII), которые могут отсутствовать у некоторых ферментов, и шесть мотивов с высокой степенью гомологии (I, IV, VI, VIII, IX и X). Между VIII и IX мотивами располо- жена вариабельная область ТRD, существенно различающаяся у сайт-специфических мети- лтрансфераз по ее аминокислотной последовательности и длине. Таким образом, консерва- тивные мотивы ответственны за осуществление обшей для всех метилтрансфераз функции каталитического переноса метильной группы с молекулы 5-аденозилметионина на ДНК, в то время как вариабельная область ТRD определяет узнавание специфической последователь- ности ДНК и метилирование в ней гетероциклического основания. Схема структуры Dnmt1 приведена на рис. 34. Рис. 34.Структура Dnmt1 – семейства ДН К-метилтрансфераз. На рис. 34 видно, что N– и С-концевые домены белка разделены G-К-повторами. Римскими цифрами обозначены основные консервативные мотивы С-концевого катали- тического домена. В N-концевом регуляторном домене отмечены функциональные после- довательности, определяющие связывание ядерного антигена пролиферируюших клеток (РСNА), сигнал ядерной локализации (NLS), нацеливание белка в точки репликации ДНК (ТRF), связывание с ионами Zn 2+ (Суs-rich), гомологию с полибромо-1-белком (РВНD). Меt(s))и Меt(о) показывают N-концевые положения соответственно соматической и ооцит- специфической форм белка. Эукариотические ДНК-металазы осуществляют метилирование цитозина в полумети- лированной реплицирующейся ДНК в симметричных последовательностях СрG и СрNpG. Это соответствует полуконсервативному (как и синтез ДНК) типу наследования кар- тины метилирования родительской ДНК, называемое поддерживающим метилированием, а также метилирование полностью неметилированных последовательностей ДНК, называ- емое метилированием dе поvо. жүктеу/скачать 2,57 Mb. Достарыңызбен бөлісу:
|