Үшінші реттік құрылымы Үшінші құрылым - бұл полипептидтік тізбектердің глобулаларға химиялық байланыстардың пайда болуы (сутегі, ион, дисульфид) және амин қышқылы қалдықтарының радикалдары арасында гидрофобты өзара әрекеттесу. Үшінші құрылымды қалыптастыруда негізгі рөлді гидрофильді-гидрофобты өзара әрекеттесу атқарады. Су ерітінділерінде гидрофобты радикалдар судан жасырынып, глобула ішінде топтасады, ал гидрофильді радикалдар гидратацияның нәтижесінде (су дипольдерімен әрекеттесу) молекула бетіне шығады. Кейбір ақуыздарда екі цистеин қалдықтарының күкірт атомдары арасында туындайтын дисульфидті ковалентті байланыс арқылы үшінші деңгейдегі құрылым тұрақтандырылады. Үшінші құрылым деңгейінде ферменттер, антиденелер, кейбір гормондар бар.
